结论前置：工厂不能仅因员工经常上厕所就辞退员工，这种做法缺乏合法依据，且可能引发劳动纠纷。

详细分析：

1. 辞退员工的合法依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位辞退员工必须基于合法、合理的理由，如员工严重违反公司规章制度、严重失职或营私舞弊给公司造成重大损害、被依法追究刑事责任等。
   • 员工经常上厕所，并不构成上述任何一种可以辞退的合法情形。因此，工厂不能仅凭此理由就辞退员工。

2. 员工上厕所的合理性：

   • 上厕所是人的基本生理需求，员工在工作期间需要上厕所是正常的生理现象，工厂应当予以理解和尊重。
   • 如果员工上厕所的频率确实过高，影响了正常的工作秩序，工厂可以与员工进行沟通，了解原因并寻求解决方案，如调整工作时间、提供必要的便利等，而不是直接辞退。

3. 辞退员工的法律后果：

   • 如果工厂违法辞退员工，员工有权向劳动仲裁机构申请仲裁，要求工厂支付违法解除劳动合同的赔偿金。
   • 赔偿金的标准通常为员工在工厂工作每满一年支付两个月工资的经济补偿。如果员工在工厂工作多年，这将是一笔不小的费用。

4. 建议与措施：

   • 工厂应当建立健全的规章制度，明确员工的行为规范和工作要求，但规章制度必须合法、合理，且经过民主程序制定并公示。
   • 对于员工上厕所的问题，工厂可以通过加强管理、提供便利等方式来引导员工合理安排时间，而不是采取辞退等极端措施。
   • 如果员工确实存在影响工作秩序的行为，工厂应当先进行警告、教育等处理，如果仍无改善，再考虑是否辞退，并确保辞退决定符合法律规定。

总结与提醒： 工厂不能仅因员工经常上厕所就辞退员工，这种做法既不合法也不合理。工厂应当尊重员工的生理需求，通过合理的管理和沟通来解决问题。如果确实需要辞退员工，必须确保辞退决定符合法律规定，否则将面临法律风险和经济损失。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。