结论：农民出租耕地后，企业变更是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及租赁合同的效力、企业变更的合法性以及是否违反相关法律法规的强制性规定。
分析角度一：租赁合同的效力
合同内容合法性：首先，农民出租耕地需确保租赁合同内容合法，即合同中约定的租赁期限、租金、用途等条款需符合《中华人民共和国农村土地承包法》等相关法律法规的规定。若合同内容合法，则农民与企业之间的租赁关系受法律保护。
合同履行情况：在合同履行过程中，农民和企业均需按照合同约定履行各自义务。若企业因经营需要变更（如股权转让、合并、分立等），需确保变更行为不影响租赁合同的继续履行，且变更后的企业继续承担原合同中的权利和义务。
分析角度二：企业变更的合法性
变更程序合法性：企业变更需遵循《中华人民共和国公司法》等相关法律法规的规定，完成相应的变更登记手续。若企业变更程序合法，且变更后的企业具备继续履行租赁合同的能力，则企业变更行为本身不违反法律法规。
变更后企业资质：若耕地租赁用途涉及特定行业或需要特定资质（如农业种植、养殖等），则变更后的企业需具备相应的资质条件。若不具备，则可能因违反法律法规的强制性规定而导致租赁合同无效或部分无效。
分析角度三：是否违反相关法律法规的强制性规定
耕地保护政策：根据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规的规定，耕地受到严格保护，禁止非法占用、转让或改变用途。若企业变更后，将耕地用于非农业用途或违反耕地保护政策，则可能面临法律制裁，且租赁合同可能因此无效。
租赁期限限制：根据《中华人民共和国农村土地承包法》的规定，耕地的承包期为三十年。若租赁合同约定的租赁期限超过承包期剩余期限，则超出部分无效。此外，若租赁期限过长且未经过相关部门批准，也可能因违反法律法规的强制性规定而无效。
法律建议：
审查租赁合同：农民在出租耕地前，应仔细审查租赁合同内容，确保合同条款合法、明确，并明确约定企业变更时的处理方式。
了解企业变更情况：在企业变更时，农民应了解变更的具体情况（如变更原因、变更后的企业资质等），并评估变更对租赁合同履行的影响。
及时咨询法律专业人士：若农民对企业变更的合法性或租赁合同的履行存在疑问，应及时咨询法律专业人士（如我，江克松律师），以便获得专业的法律意见和帮助。
可能法律后果：
若企业变更行为违反法律法规的强制性规定或租赁合同约定，农民有权要求变更后的企业继续履行合同、承担违约责任或解除合同并要求赔偿损失。同时，相关企业也可能面临行政处罚或刑事责任等法律后果。因此，农民和企业均应谨慎对待耕地租赁和企业变更事宜，确保合法合规。