结论前置：五一假期公司只放三天假是否合法，主要取决于国务院当年公布的五一劳动节放假安排。若国务院规定的假期天数等于或少于三天，则公司放三天假是合法的；若规定的假期天数超过三天，而公司仅放三天，则是不合法的，公司需对员工进行补偿。
详细分析：
法定节假日与调休制度：
- 五一劳动节作为法定节假日，其具体的放假天数由国务院提前公布，并通过官方渠道发布。这一规定对所有企业，包括私营企业，均具有法律约束力。
- 法定节假日可能会通过调休的方式形成连休假期，以更好地保障劳动者的休息权利。例如，若五一当天是工作日，可能会通过调休周末的方式形成连续的假期。
公司放假安排的合法性判断：
- 如果国务院公布的五一劳动节放假安排是三天或更少，那么公司在该期间给员工放三天假是合法的，且必须遵守这一法律规定。
- 如果国务院公布的放假安排超过三天，而公司仅放三天假，则属于违法行为。此时，公司应当对员工进行补偿，如支付加班费或安排调休等。具体来说，若公司在法定节假日安排员工工作，应按照《劳动法》的规定支付不低于工资的300%的工资报酬；若在调休的休息日安排员工工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的200%的工资报酬。
特殊情况下的工作安排与补偿：
- 在某些特殊情况下，如因生产经营需要确需在法定节假日工作的，公司必须按照《劳动法》的规定支付加班费或进行调休等安排。这是公司应尽的法律义务，也是保障员工合法权益的重要措施。
劳动者的权益保护：
- 劳动者在遇到公司不依法安排休假或支付相应报酬的情况时，可以先与公司进行友好沟通协商，要求其依法安排休假或支付相应报酬。
- 若协商不成，劳动者有权向当地劳动监察部门投诉举报，或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。这是劳动者维护自身权益的有效途径，也是促进公司依法经营的重要手段。
法律建议：
- 对于公司而言，应密切关注国务院公布的法定节假日放假安排，并依法安排员工的休假和加班事宜。若因生产经营需要确需在法定节假日安排员工工作的，应提前与员工沟通协商，并依法支付加班费或安排调休。
- 对于劳动者而言，应了解自己的合法权益，并在必要时采取适当措施来维护这些权益。若遇到公司不依法安排休假或支付相应报酬的情况，可以先与公司协商解决；若协商不成，可以向当地劳动监察部门投诉举报或申请劳动仲裁。
可能法律后果：
- 若公司不依法安排休假或支付相应报酬，可能会面临劳动监察部门的处罚和劳动者的法律诉讼。这不仅会影响公司的声誉和形象，还可能给公司带来经济损失和法律风险。因此，公司应严格遵守国家法律法规和国务院的放假通知，保障员工的合法权益。