结论前置：老板让加班却扣工资的行为一般不合法，但具体是否违法需结合加班性质、工资构成及公司制度综合判断。以下分情况说明：
1. 若属于“法定标准工作时间外加班”
根据《劳动法》第44条，用人单位安排劳动者在标准工作时间（每日8小时、每周40小时）以外加班的，需支付加班费，不得以扣工资替代：
- 工作日加班：支付不低于工资150%的加班费；
- 休息日加班：若不能安排补休，支付不低于工资200%的加班费；
- 法定节假日加班：支付不低于工资300%的加班费。
若公司以“扣工资”形式拒绝支付加班费，属于违法行为，劳动者可要求公司补发，并向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
2. 若属于“自愿加班且未超法定时长”
若劳动者自愿加班（非公司安排），且总工作时间未超过《劳动法》第36条规定的每日不超过8小时、平均每周不超过44小时的限度，公司可能无需支付加班费。但公司仍无权扣减工资，除非劳动者存在旷工、违纪等行为导致工资扣减（需符合公司合法制定的规章制度）。
3. 若公司以“绩效扣减”等名义变相扣工资
部分公司可能以“绩效不达标”“未完成工作任务”等理由扣减工资，但需满足以下条件才合法：
- 制度合法：扣减规则需经民主程序制定（如职工代表大会讨论）、公示并告知劳动者；
- 内容合理：扣减比例不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准；
- 与加班无关：若扣减与加班行为无直接关联（如因工作失误扣款），则需单独评估合法性。
若公司以加班为由随意扣减工资，属于违法行为，劳动者可主张权利。
应对建议
- 收集证据：保留加班记录（如考勤表、加班通知）、工资条、劳动合同等，证明加班事实及扣减工资情况；
- 与公司协商：向HR或上级说明法律规定，要求补发工资；
- 投诉或仲裁：若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉（电话12333），或申请劳动仲裁（需在1年内提出）；
- 注意时效：劳动争议申请仲裁的时效为1年，自知道或应当知道权利被侵害之日起计算。
温馨提示：若您遇到类似情况，可直接向我咨询具体细节（如加班时长、工资构成等），我会帮您进一步分析合法性及维权方案。