结论：在父亲去世后，回迁协议上虽是父亲的名字，但若该房产属于父母婚姻期间的共同财产，则不能直接将母亲那一部分也公证给子女。需要先进行析产，明确父亲在房产中的份额，再通过继承公证或遗嘱继承等方式，将父亲享有的份额过户给子女。

详细分析：

1. 房产权属确认：

   • 若回迁协议（通常视为房产的权益证明）上名字为父亲，且该房产为父母婚姻期间所得（无特别约定），则此房产属于父母的夫妻共同财产。这意味着，房产的一半份额属于母亲，另一半份额属于父亲。
   • 父亲去世后，其享有的房产份额（即一半）将作为遗产进行分配。

2. 继承关系确定与过户途径：

   • 继承公证：
     • 首先需对房产进行析产，明确父亲在房产中的具体份额（一般为一半）。
     • 随后，所有有继承权的人（包括母亲、所有子女等）需共同到公证处办理继承公证。在此过程中，其他继承人（如母亲和其他子女）应明确表示放弃对父亲房产份额的继承权，或者通过协商达成一致，同意由指定子女继承父亲的份额。但需要注意的是，母亲只能放弃或处理自己继承父亲份额的权利，不能直接放弃或处理自己原本就拥有的房产份额。
     • 凭公证书等相关材料，可前往不动产登记部门办理过户手续，将父亲享有的份额过户给指定子女。
   • 遗嘱继承：
     • 若父亲去世前立下了合法有效的遗嘱，并明确指定了房产份额的继承人，则应按照遗嘱执行过户。但同样，遗嘱只能处理父亲享有的房产份额，不能涉及母亲原本就拥有的份额。
   • 诉讼解决争议：
     • 若各继承人之间对房产继承存在争议，无法达成一致，可通过向法院提起继承诉讼来解决。法院将依法判决，并根据生效判决办理房产过户手续。

3. 关于母亲份额的处理：

   • 母亲的房产份额是其个人财产，不属于遗产范围。因此，在父亲去世后，母亲可以自由决定如何处理自己的份额，如保留、出售或赠与给子女等。但这与父亲份额的继承是两个独立的法律行为。

操作建议与注意事项：

• 充分沟通：与其他家庭成员进行充分沟通，了解他们的意愿和诉求，确保整个过户过程得到大家的支持和配合。特别是与母亲沟通，明确她对自己房产份额的处理意愿。
• 专业咨询：在处理此类复杂法律问题时，建议咨询专业律师（即我，顾晨骋律师）以获取更详细的指导和帮助。我可以根据具体情况提供个性化的法律建议。
• 准备材料：提前准备好相关证件和材料，如回迁协议、房产证、身份证、死亡证明、继承公证书等，以便在办理过户时能够顺利进行。

综上所述，处理父亲去世后的回迁房产过户问题需谨慎对待，遵循相关法律规定，确保所有继承人的权益得到妥善保护。通过析产、继承公证或遗嘱继承等途径，可以合法有效地完成房产份额的过户手续。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。