结论：员工在部门要求其离职后不干活且不配合工作交接，是否需要赔偿需分情况讨论，主要取决于员工不干活及不配合交接的行为是否违反了公司的规章制度、劳动合同的约定以及是否给公司造成了实际损失。
分析如下：
员工不干活的行为：
- 如果员工在部门明确要求其离职后，未按照正常流程办理离职手续，而是擅自停止工作，这可能构成旷工或违反公司规章制度的行为。根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条的规定，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同，且无需支付经济补偿。但此条款主要关注的是用人单位解除劳动合同的权利，并未直接规定员工需因此赔偿。然而，如果员工的不干活行为导致公司遭受了实际损失（如项目延误、客户流失等），公司有权要求员工赔偿这部分损失。
员工不配合工作交接的行为：
- 工作交接是离职流程中的重要环节，员工有义务配合完成。如果员工故意不配合工作交接，导致公司无法正常运营或遭受损失，公司同样有权要求员工赔偿。这种赔偿通常基于员工的不当行为给公司造成的实际损失来确定。
赔偿的法律依据与计算：
- 赔偿的法律依据主要来源于《中华人民共和国劳动合同法》及相关司法解释中关于劳动者违约责任的规定。具体赔偿金额的计算，则需根据员工的不当行为给公司造成的实际损失来确定，包括但不限于直接经济损失、间接经济损失（如因项目延误导致的额外成本）等。
- 在实际操作中，公司需要提供充分的证据证明员工的不当行为与其遭受的损失之间存在因果关系，以及损失的具体金额。这可能需要公司收集相关的财务记录、项目进度报告、客户反馈等证据。
公司的应对措施：
- 如果员工存在不干活或不配合工作交接的行为，公司应首先尝试与员工进行沟通，了解其不配合的原因，并尝试通过协商解决问题。
- 如果沟通无果，公司可以依据公司规章制度或劳动合同的约定，对员工进行纪律处分，甚至解除劳动合同。
- 在解除劳动合同的同时，公司应保留好相关证据，以便在必要时向员工主张赔偿。
建议：
- 对于公司而言，应建立健全的规章制度和劳动合同条款，明确员工在离职时的义务和责任，以及违反这些义务和责任可能面临的后果。
- 对于员工而言，应遵守公司的规章制度和劳动合同的约定，在离职时积极配合工作交接，以避免不必要的法律纠纷和赔偿责任。
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