您好，关于您提出的“请假超过3个月属于自离这种制度是否适用于孕妇”的问题，我可以明确地告诉您，这种制度在孕妇身上是不适用的。以下是我为您详细解释的原因：

首先，我们需要明确的是，女职工在孕期、产期、哺乳期内享有特殊的劳动保护权益，这是由相关法律法规明确规定的。这些权益包括但不限于：不得因怀孕、生育、哺乳而降低工资、予以辞退、解除劳动合同或聘用合同；在孕期不能适应原劳动的，用人单位应根据医疗机构的证明，减轻劳动量或安排其他能够适应的劳动；以及在孕期、产期、哺乳期内劳动合同期满的，劳动合同应顺延至相应期满等。

针对您提到的“请假超过3个月属于自离”的制度，这通常是企业内部的一种考勤管理规定。然而，对于孕妇而言，由于她们在孕期可能会遇到各种生理不适，如先兆流产、孕吐等，这些情况往往需要长时间的休息和调养。在这种情况下，如果孕妇能够提供医疗机构的证明，并按照规定履行请假手续，那么她们的请假行为是不应被视为旷工或自离的。

以实际案例为例，有女职工在孕期因先兆流产被医生建议休假，她向领导请假并提供了相关医疗证明。尽管公司最初拒绝了她的请假申请，但法院最终判决认为，女职工的离岗情形不符合旷工认定标准，且在员工处于孕期并有医疗证明的情况下，用人单位应给予必要的理解和支持。这一案例充分说明了，对于孕妇的请假行为，不能简单地套用企业的考勤管理规定，而应结合其身体实际和法律法规进行灵活处理。

此外，根据《江西省女职工劳动保护特别规定》等相关法律法规，女职工在孕期有先兆流产症状或有习惯性流产史，申请保胎休息期间的工资支付也有明确规定。如果女职工需保胎休息三个月以上的，其休息期间的工资可以按工资的百分之七十至百分之百发给。这也进一步体现了法律法规对孕妇的特殊保护。

综上所述，对于孕妇而言，“请假超过3个月属于自离”的制度是不适用的。用人单位在处理孕妇的请假行为时，应充分考虑其身体实际和法律法规的规定，给予必要的理解和支持。如果您或您身边的孕妇朋友遇到了类似的问题，建议及时咨询专业律师或相关劳动部门，以维护自身的合法权益。