在法院二审判决确认行政行为违法后，提起行政赔偿及行政赔偿诉讼的期限主要依据《中华人民共和国国家赔偿法》及相关司法解释的规定。以下是对此问题的详细解答：
一、行政赔偿请求的提出期限
一般规定：
- 根据《中华人民共和国国家赔偿法》第九条第二款，赔偿请求人要求赔偿，应当先向赔偿义务机关提出，也可以在申请行政复议或者提起行政诉讼时一并提出。这意味着，在确认行政行为违法后，您可以直接向作出违法行政行为的机关提出赔偿请求。
具体期限：
- 虽然《国家赔偿法》未明确规定在确认违法后提出赔偿请求的具体期限，但通常建议尽快提出，以便及时获得赔偿。如果赔偿义务机关在规定期限内未作出赔偿决定，或者您对赔偿决定有异议，可以进一步提起行政赔偿诉讼。
二、行政赔偿诉讼的提起期限
直接提起行政赔偿诉讼：
- 如果您选择直接提起行政赔偿诉讼，而不经过赔偿义务机关先行处理，那么应当遵循《中华人民共和国行政诉讼法》关于起诉期限的规定。根据该法第四十六条，您应当自知道或者应当知道作出行政行为（即确认违法）之日起六个月内提出诉讼。
经过赔偿义务机关先行处理后提起诉讼：
- 如果您先向赔偿义务机关提出了赔偿请求，但赔偿义务机关在规定期限内未作出赔偿决定，或者您对赔偿决定有异议，那么您可以在收到赔偿决定书之日起三个月内，或者自赔偿义务机关作出赔偿决定期限届满之日起三个月内，向人民法院提起行政赔偿诉讼。这一期限是根据《最高人民法院关于审理行政赔偿案件若干问题的规定》第十三条确定的。
三、特殊情况下的期限考虑
不可抗力或其他正当理由：
- 如果因不可抗力或者其他正当理由耽误了上述期限，您可以在障碍消除后的十日内，申请延长期限。是否准许由人民法院决定。
最长保护期限：
- 需要注意的是，虽然《国家赔偿法》未明确规定行政赔偿诉讼的最长保护期限，但根据《行政诉讼法》及相关司法解释的精神，从行政行为作出之日起（对于涉及不动产的案件为二十年，其他案件为五年）超过这个期限的，人民法院可能不再受理相关诉讼。不过，在行政赔偿诉讼中，这一最长保护期限的适用可能更为复杂，需要结合具体案情和法律规定进行判断。
四、建议与总结
及时行动：
- 在确认行政行为违法后，建议您尽快向赔偿义务机关提出赔偿请求，并在必要时及时提起行政赔偿诉讼，以避免因期限问题而丧失获得赔偿的权利。
咨询专业意见：
- 由于行政赔偿诉讼涉及复杂的法律问题和程序要求，建议您在提起诉讼前咨询专业律师的意见，以确保您的权益得到充分保障。
准备充分证据：
- 在提起行政赔偿诉讼时，您需要准备充分的证据来证明行政行为的违法性、您因此遭受的损失以及损失与行政行为之间的因果关系等。这将有助于您在诉讼中取得有利的结果。
总结来说，在法院二审判决确认行政行为违法后，您应当尽快向赔偿义务机关提出赔偿请求，并在必要时在法定期限内提起行政赔偿诉讼。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。