公司仅与员工签订合作协议，而不签订正式的劳动合同，这种做法在法律上通常是无效的，不能完全替代劳动合同来确立劳动关系。以下从几个角度详细分析：

1. 法律性质与目的：

   • 劳动合同：是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。它受到《中华人民共和国劳动合同法》等法律法规的严格保护，旨在保障劳动者的合法权益，如获得劳动报酬、享受社会保险和福利等。
   • 合作协议：通常用于确立双方之间的合作关系，如项目合作、业务合作等。它更多地关注合作的具体内容、方式、期限以及双方的权利义务分配，并不直接涉及劳动关系的建立。

2. 法律效力：

   • 如果公司仅与员工签订合作协议，而未签订劳动合同，且合作协议的内容并未涵盖劳动合同应有的要素（如工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬、社会保险等），那么这份合作协议在法律上可能无法被认定为劳动合同，从而无法有效确立劳动关系。
   • 在这种情况下，如果员工主张与公司存在劳动关系，并要求公司承担相应的法律责任（如支付未签订劳动合同的双倍工资、补缴社会保险等），公司可能会面临法律风险。

3. 实际案例与司法实践：

   • 在司法实践中，法院或劳动仲裁机构通常会根据合作协议的具体内容、双方的实际履行情况以及劳动关系的实质特征（如劳动者是否接受用人单位的管理、是否从事用人单位安排的有报酬的劳动等）来判断双方是否存在劳动关系。
   • 如果合作协议实际上构成了劳动关系，而公司又未与员工签订劳动合同，那么公司可能会被视为违反了《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，从而需要承担相应的法律责任。

4. 建议与风险防范：

   • 对于公司：为了避免法律风险，公司应当与员工签订正式的劳动合同，明确双方的权利和义务。如果确实需要与员工建立合作关系，也应当签订合作协议，并确保合作协议的内容不与劳动合同相冲突，且不损害员工的合法权益。
   • 对于员工：如果公司仅与你签订合作协议而未签订劳动合同，你有权要求公司签订正式的劳动合同。如果公司拒绝或拖延签订，你可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

总结来说，公司仅与员工签订合作协议而不签订劳动合同的做法在法律上通常是无效的。为了保障双方的合法权益，公司应当与员工签订正式的劳动合同。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。