乙方不履行工程合同，赔偿方式主要取决于合同约定及法律规定，具体分以下情况处理：

1. 合同有明确违约责任条款
   若合同中已约定乙方不履行义务的违约金或赔偿计算方式（如“逾期完工按日支付合同总价0.1%违约金”），甲方可直接依据合同要求乙方支付违约金或赔偿损失。
   注意：违约金过高或过低时，法院可能根据实际损失调整（如约定违约金超过损失30%的，可能被认定为过高）。

2. 合同未约定违约责任，但甲方有实际损失
   若合同未明确违约金，甲方可要求乙方赔偿实际损失，包括：

   • 直接损失：如甲方为履行合同已支付的款项、采购的材料费用等；
     
   • 间接损失：如因乙方违约导致甲方延误工期，需向第三方支付的违约金或额外费用（需证明损失与乙方违约的因果关系）。
     示例：乙方中途停工导致甲方需紧急委托其他公司完成工程，多支付的工程款可主张赔偿。

3. 乙方根本违约，甲方可解除合同并索赔
   若乙方行为构成根本违约（如明确表示不履行、逾期完工超过合理期限等），甲方有权解除合同，并要求乙方赔偿：

   • 合同履行后可获得的利益（即“预期利益损失”）；
     
   • 已发生的实际损失。
     注意：甲方需提供证据证明预期利益损失（如利润计算依据、行业平均利润率等）。

4. 乙方拒不赔偿，甲方可通过法律途径解决
   若协商无果，甲方可向法院起诉或申请仲裁（依合同约定），需准备以下证据：

   • 双方签订的工程合同；
     
   • 乙方违约的证据（如停工通知、沟通记录、现场照片等）；
     
   • 损失计算的依据（如发票、付款凭证、第三方报价单等）。

建议行动步骤：

1. 立即书面催告乙方履行合同，固定其违约证据；
   
2. 核对合同条款，明确违约责任及赔偿方式；
   
3. 评估实际损失，保留相关凭证；
   
4. 协商无果后，尽快启动法律程序，避免超过诉讼时效（一般为3年）。
   

如有具体合同条款或损失情况，可进一步向我说明，我会帮你分析赔偿方案。