客户要回扣给了公司，公司是否算违法，需分情况讨论：
若公司知情并默许或主动索要回扣：
- 法律定性：公司可能构成商业贿赂或单位受贿罪（若涉及国家工作人员）。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，单位为谋取不正当利益而行贿，或者违反国家规定，收受各种名义的回扣、手续费，归单位所有的，以单位行贿罪或单位受贿罪论处。同时，若公司直接负责的主管人员和其他直接责任人员参与其中，也将面临相应的刑事责任。
- 法律后果：公司可能面临罚款、没收违法所得、吊销营业执照等行政处罚，以及刑事责任（如单位受贿罪，可处五年以下有期徒刑或者拘役）。相关责任人员也可能面临刑事处罚。
若公司不知情，是员工个人行为：
- 法律定性：员工个人收受回扣可能构成非国家工作人员受贿罪（若员工非国家工作人员）或受贿罪（若员工为国家工作人员）。公司本身不直接构成犯罪，但可能因管理不善而承担一定的民事责任或行政责任，如因员工行为导致公司声誉受损或经济损失，公司可能需向受害方承担赔偿责任。
- 法律后果：员工个人将面临刑事处罚，如非国家工作人员受贿罪，可处五年以下有期徒刑或者拘役；数额巨大的，处五年以上有期徒刑，可以并处没收财产。公司则可能因管理问题受到行政处罚或民事赔偿。
特殊情况：回扣作为合法折扣或佣金：
- 法律定性：如果回扣实际上是以折扣、佣金等形式出现，且符合相关法律法规的规定（如《中华人民共和国反不正当竞争法》中关于商业贿赂的除外规定），则可能不构成违法。但需注意，这种折扣或佣金必须明示并如实入账，否则仍可能被视为商业贿赂。
- 法律后果：若回扣符合合法折扣或佣金的条件，则公司无需承担法律责任。但公司需确保相关交易符合法律法规的规定，并保留好相关证据以备查验。
建议：
- 公司应建立健全内部管理制度，明确禁止员工收受回扣等不正当利益，并加强对员工的法律培训，提高员工的法律意识。
- 若公司发现员工收受回扣，应立即进行调查并采取措施，如解除劳动合同、向相关部门举报等，以避免公司承担不必要的法律责任。
- 公司应定期进行合规审查，确保所有交易均符合法律法规的规定，避免涉及商业贿赂等违法行为。
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