员工多次违规时，用人单位在遵循法律规定和条件的前提下，可以合理扣除工资，但必须确保扣除行为合法、合规，且不得损害员工的合法权益。以下从多个角度为您详细分析：
一、合法扣工资的情形
规章制度明确规定：
- 如果用人单位依法制定的规章制度中，明确规定了员工违规行为对应的扣薪情形和标准，并且这些规章制度的制定经过了民主程序（如职工代表大会讨论通过），且已向员工公示告知，那么在员工出现相应违规行为时，用人单位可以按规定扣工资。例如，规章制度中规定“员工迟到一次扣工资50元”，且该规定已经公示并告知员工，那么员工迟到后，用人单位可以据此扣工资。
劳动合同有约定：
- 若劳动合同中明确约定了员工违规行为导致扣薪的具体条款，且这些条款不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位可以按约定执行。比如，劳动合同中约定“员工因工作失误给公司造成损失的，公司有权从其工资中扣除相应赔偿”，在员工确实因工作失误给公司造成损失时，用人单位可以据此扣工资。
给单位造成经济损失：
- 根据《工资支付暂行规定》，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可要求劳动者赔偿，并从其工资中扣除，但每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。例如，员工因疏忽大意导致公司货物损坏，公司要求员工赔偿，且每月从员工工资中扣除的赔偿金额不超过员工当月工资的20%，同时确保扣除后员工工资不低于当地最低工资标准，这是合法的。
法定代扣情形：
- 包括代扣代缴的个人所得税、保险费用、法院判决或裁定要求的抚养费、赡养费，以及法律、法规规定的其他可从工资中扣除的费用。这些情形下的扣工资是法律明确规定的，用人单位可以依法执行。
二、非法扣工资的情形
缺乏明确依据：
- 用人单位若无明确的规章制度依据或劳动合同约定，随意以员工违规为由扣工资，则为不合法行为。比如，用人单位没有制定任何关于员工违规扣工资的规章制度，也没有在劳动合同中约定相关条款，却以员工违规为由扣工资，这是违法的。
扣除金额不合理：
- 即使存在扣工资的情形，但若扣除金额过高或明显不合理，也可能被认定为违法。例如，员工只是轻微违规，用人单位却一次性扣除员工一个月的工资，这种扣除金额显然过高且不合理，是违法的。
无故扣除工资：
- 用人单位无故扣除劳动者工资，或扣除理由不符合上述合法情形，均属违法行为。根据相关法律法规，用人单位需承担相应的法律责任。比如，用人单位没有合理的理由，就随意扣除员工工资，这是违法的，员工有权要求用人单位返还被扣除的工资。
三、劳动者维权途径
协商解决：
- 员工认为用人单位扣工资行为不合法时，首先可与用人单位进行协商解决。通过友好沟通，尝试达成双方都能接受的解决方案。
投诉与仲裁：
- 协商不成时，员工可向当地劳动监察部门投诉，或向劳动仲裁委员会申请仲裁。投诉或申请仲裁时，员工需提供相关证据以证明用人单位的扣工资行为不合法，如工资条、规章制度、劳动合同等。
诉讼：
- 对劳动仲裁委员会的裁决结果不服时，员工可向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。在诉讼过程中，员工需要提供充分的证据来支持自己的主张。
总结来说，员工多次违规时，用人单位可以扣工资，但必须确保扣除行为合法、合规，且不得损害员工的合法权益。如果员工认为用人单位的扣工资行为不合法，可以通过协商、投诉、仲裁或诉讼等途径来维护自己的权益。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。