结论：公司未在离职时告知启用竞业协议，而您入职新公司后被告知要赔偿，这一做法不一定合法，具体取决于竞业限制协议的约定以及公司的实际履行情况。以下从不同角度为您详细分析：
一、竞业限制协议的生效条件
书面约定：竞业限制协议必须是书面形式，且明确约定了竞业限制的范围、地域、期限以及经济补偿等关键条款。如果协议本身存在瑕疵，如未明确经济补偿标准，可能影响其法律效力。
双方合意：竞业限制协议是用人单位与劳动者之间的约定，必须基于双方的真实意思表示。如果公司在签订协议时存在欺诈、胁迫等情形，或者您对协议内容存在重大误解，您有权请求撤销该协议。
二、公司未告知启用的法律后果
未支付经济补偿：根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位在竞业限制期限内应按月给予劳动者经济补偿。如果公司未在离职时告知启用竞业协议，且未支付经济补偿，您有权拒绝履行竞业限制义务，并可能无需承担赔偿责任。
通知义务：虽然法律未明确规定公司必须在离职时告知启用竞业协议，但基于诚信原则和公平原则，公司有义务在合理时间内通知您竞业限制协议的启用情况，并支付相应的经济补偿。如果公司未履行这一义务，可能构成违约，您有权要求公司承担违约责任。
三、您的应对策略
审查协议内容：首先，您需要仔细审查竞业限制协议的内容，特别是关于经济补偿、竞业限制期限和范围等关键条款。如果协议存在瑕疵或不明确之处，您可以据此提出抗辩。
收集证据：您需要收集相关证据，如公司未支付经济补偿的凭证、您入职新公司的证明等，以证明公司未履行竞业限制协议的相关义务。
协商或诉讼：您可以尝试与公司协商解决此事，要求公司撤销赔偿要求或支付相应的经济补偿。如果协商无果，您可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益，如向劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼。
四、可能面临的法律后果
如果公司胜诉：如果法院认定竞业限制协议有效且您违反了协议约定，您可能需要承担赔偿责任，赔偿金额通常根据公司的实际损失和您的违约程度来确定。
如果您胜诉：如果法院认定竞业限制协议存在瑕疵或公司未履行相关义务，您可能无需承担赔偿责任，甚至可能要求公司承担违约责任。
建议：鉴于竞业限制协议涉及复杂的法律问题，且每个案件的具体情况都有所不同，我建议您在处理此事时务必谨慎。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业的法律意见和解决方案。