员工辞职时，工资原则上应当一次性结清，但具体支付方式可能因用人单位的工资发放制度及实际情况而有所不同。以下是对此问题的详细分析：

一、法律规定与原则

1. 《工资支付暂行规定》第九条明确规定，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这一规定确保了劳动者在离职后能够及时获得全部应得报酬，避免生活上的困难和经济上的损失。

2. 《中华人民共和国劳动合同法》第五十条也强调，用人单位在解除或终止劳动合同时，需出具相关证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续，同时结清工资报酬。这进一步巩固了劳动者在离职时的经济权益。

二、实际操作中的支付方式

1. 立即结清：

   • 在员工与用人单位就离职事宜达成一致，并办理完工作交接等手续的情况下，许多单位会选择立即结清工资。这种做法能够避免后续纠纷，维护良好的劳资关系，特别常见于小型企业或管理规范、注重员工关系的企业。

2. 按照公司常规发薪日支付：

   • 部分用人单位会遵循既定的工资发放周期来支付离职员工的工资。例如，如果公司规定每月15日发放上月工资，而员工在本月10日辞职，公司可能会等到下月15日再发放该员工的工资。但这种做法必须建立在用人单位明确告知劳动者且不违反当地相关规定的前提下，否则可能构成拖欠工资。

三、特殊情况下的处理

尽管法律倾向于一次性结清工资，但实际操作中可能存在特殊情况导致无法立即全部结清，例如：

• 工资核算存在争议，如对加班时间、绩效奖金计算方式等有分歧，可能无法当场完成准确核算。
• 因财务流程等客观原因，用人单位无法立即支付工资。

在这些情况下，用人单位应与劳动者进行协商，确定一个合理的支付期限，并明确告知劳动者延迟支付的原因和预计支付时间。这种协商必须基于平等、自愿的原则，且不能违反法律法规的强制性规定。

四、员工权益保护措施

如果用人单位未按规定一次性结清工资，员工可采取以下措施维护自身权益：

1. 与用人单位协商：首先尝试与用人单位进行沟通，要求其按照法律规定及时支付工资。

2. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，员工可向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令用人单位限期支付工资。

3. 申请劳动仲裁：如问题仍未解决，员工可申请劳动仲裁，要求用人单位支付工资及相应的经济补偿。

五、建议与注意事项

• 提前通知与交接：劳动者在辞职前应确保按照法定程序提前通知用人单位，并办理好工作交接手续，以确保离职过程的顺利进行。

• 证据收集：在离职过程中，劳动者应注意收集能证明自己工作时间、工作量以及工资标准等方面的证据，如考勤记录、工作成果、工资条等，以备不时之需。

• 了解规定：劳动者在入职时应详细了解用人单位的工资发放制度及相关规定，以便在离职时能够做出合理的预期和安排。

综上所述，员工辞职时工资的结算方式需结合劳动法律法规的规定及用人单位的具体制度来确定。无论采取何种方式，用人单位都应确保及时、足额地支付劳动者的工资，以维护劳动者的合法权益。如果用人单位无故拒绝或拖延支付工资，员工有多种途径可以维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。