自然人挂靠公司办理业务时，若符合一定条件，自然人是可以以原告身份起诉对方的。以下从不同角度进行分析：
一、法律关系分析
挂靠关系的本质：
- 挂靠关系通常指的是自然人（挂靠人）以某一具有资质或特定条件的企业（被挂靠人）的名义从事经营活动，并向被挂靠人支付一定费用的行为。
- 在这种关系中，挂靠人虽然以被挂靠人的名义行事，但实际的经济利益和风险往往由挂靠人承担。
诉讼主体资格：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，原告是与本案有直接利害关系的公民、法人和其他组织。
- 若挂靠人在挂靠经营过程中，因对方的行为（如违约、侵权等）遭受了损失，且该损失与挂靠行为有直接关联，那么挂靠人作为直接利害关系人，有权以原告身份提起诉讼。
二、实际操作中的考虑因素
合同相对性原则：
- 如果挂靠人与对方之间签订了合同，且合同中明确约定了双方的权利和义务，那么挂靠人可以直接依据合同起诉对方。
- 即使合同是以被挂靠人的名义签订的，但如果挂靠人能够证明其是实际履行合同的一方，且对方对此明知或应知，那么挂靠人仍可能被认定为合同的实际当事人，从而具备原告资格。
证据收集与证明：
- 挂靠人在起诉时，需要提供充分的证据证明其与对方之间存在法律关系（如合同、交易记录、沟通记录等），以及对方的行为给其造成了损失。
- 同时，挂靠人还需要证明其与被挂靠人之间的挂靠关系，以及该关系与诉讼标的之间的关联性。
被挂靠人的态度：
- 在某些情况下，被挂靠人可能愿意作为共同原告或第三人参与诉讼，以协助挂靠人维护权益。
- 但如果被挂靠人拒绝参与或无法联系，挂靠人仍可以单独提起诉讼，但可能需要承担更多的举证责任。
三、法律建议
明确合同条款：
- 在挂靠经营过程中，建议挂靠人与对方签订明确的合同，并详细约定双方的权利和义务、违约责任等条款。
- 同时，可以在合同中明确挂靠人的地位和作用，以便在发生纠纷时能够更清晰地界定各方的责任。
保留相关证据：
- 挂靠人应妥善保留与对方之间的交易记录、沟通记录、合同等证据材料，以便在起诉时能够提供充分的证明。
咨询专业律师：
- 在涉及复杂法律关系或证据收集困难的情况下，建议挂靠人咨询专业律师的意见，以便更好地维护自己的合法权益。
总结来说，自然人挂靠公司办理业务时，若因对方的行为遭受了损失，且能够证明其与对方之间存在法律关系以及该损失与挂靠行为有直接关联，那么自然人是可以以原告身份起诉对方的。在实际操作中，建议挂靠人明确合同条款、保留相关证据，并在必要时咨询专业律师的意见。