检察院作出不起诉决定后仍扣押金钱，通常涉及以下几种法律情形及处理原则：

1. 扣押措施与案件关联性未完全解除
   根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，检察院在审查起诉阶段可能因案件需要采取扣押措施（如冻结涉案账户、扣押赃款等）。若检察院作出不起诉决定，但认为扣押的金钱仍与案件存在关联（例如需作为民事赔偿的预留资金、涉及其他违法犯罪线索的进一步核查等），可能暂不解除扣押。此时，需结合具体案情判断扣押的合法性：

   • 若扣押金钱确属涉案财物（如赃款、违法所得），且未通过退赔、没收等程序处理完毕，检察院可能依据《人民检察院刑事诉讼规则》第176条，在不起诉决定生效后，将财物移送有关主管机关处理（如公安机关、行政机关），或依法返还被害人。
     
   • 若扣押金钱与案件无关（如误扣、超范围扣押），当事人可依据《国家赔偿法》第18条，向检察院申请国家赔偿，要求解除扣押并返还财物。

2. 民事赔偿或行政处罚的预留
   不起诉决定仅终结刑事诉讼程序，不涉及民事赔偿或行政处罚的效力。若案件中存在民事赔偿请求（如被害人要求赔偿损失），或行政机关拟对涉案行为作出行政处罚（如罚款），检察院可能扣押金钱作为后续执行的保障。例如：

   • 刑事附带民事赔偿：若被害人提起附带民事诉讼，检察院可能扣押涉案金钱以确保赔偿执行，此时需通过法院民事判决确定赔偿金额后处理。
     
   • 行政处罚衔接：若涉案行为同时违反行政法规（如非法经营、逃税等），行政机关可能要求检察院暂不解除扣押，以便后续作出行政处罚决定。

3. 程序瑕疵或权利救济途径
   若检察院扣押金钱的程序存在瑕疵（如未依法出具扣押决定书、未告知当事人权利等），当事人可通过以下途径维权：

   • 申请复议：依据《刑事诉讼法》第117条，向作出扣押决定的检察院申请复议，要求解除扣押或返还财物。
     
   • 申诉或控告：若复议未获支持，可向上一级检察院申诉，或向同级或上级检察院控告办案人员违法。
     
   • 国家赔偿：若扣押行为被确认违法，可依据《国家赔偿法》第21条，向作出不起诉决定的检察院申请赔偿。

法律建议：

• 核实扣押依据：要求检察院出具扣押决定书及相关法律文书，明确扣押的法律依据、范围及期限。
  
• 区分财物性质：若扣押金钱涉及个人合法财产（如工资、储蓄等），需提供证据证明其与案件无关，要求立即解除扣押。
  
• 及时行使权利：若对扣押有异议，应在法定期限内申请复议或申诉，避免因拖延丧失救济机会。
  

示例：
若张三因涉嫌诈骗被检察院扣押账户内10万元，后检察院作出存疑不起诉决定，但认为其中5万元可能涉及其他案件线索，暂不解除扣押。此时，张三可要求检察院说明扣押理由，若无法证明5万元与案件关联，可申请复议或国家赔偿；若涉及其他案件，需等待相关程序终结后处理。

如有具体案情或进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合证据材料提供详细法律意见。