超过诉讼时效，法院应驳回诉讼请求，而非驳回起诉。这一结论基于以下多角度的分析：

一、驳回起诉与驳回诉讼请求的本质区别

1. 驳回起诉：这是法院在立案后，发现原告的起诉不符合法律规定的起诉条件时，从程序上予以否定的行为。它主要解决的是起诉是否符合受理条件的程序问题，如原告主体不适格、被告不明确、重复起诉等。

2. 驳回诉讼请求：这是法院对原告的实体请求经审理后认为不成立，从实体上对原告的请求予以否定的行为。它处理的是原告与被告之间的实体权利义务问题，如原告主张的权利因超过诉讼时效而丧失胜诉权。

二、超诉讼时效适用驳回诉讼请求的法律依据及原因

• 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第一百九十二条，诉讼时效期间届满的，义务人可以提出不履行义务的抗辩。这意味着，当诉讼时效期间届满后，权利人丧失的是胜诉权，即其权利在法律上不再受到保护，但并未丧失起诉权。

• 原因分析：

  • 起诉权的保留：起诉是原告的基本权利，只要符合《中华人民共和国民事诉讼法》规定的起诉条件，即使超过诉讼时效，法院也应当受理。这体现了法律对原告诉权的尊重和保护。
  • 胜诉权的丧失：虽然原告可以起诉，但由于超过了诉讼时效，其已经丧失了胜诉权。这意味着，即使原告的起诉被法院受理，其诉讼请求也难以得到法院的支持。
  • 法院的裁判原则：如果义务人提出诉讼时效抗辩，且法院经审理认为抗辩事由成立的，将判决驳回权利人的诉讼请求。这表明，法院在处理超过诉讼时效的案件时，会依法对原告的实体权利进行审查，并作出相应的裁判。
  • 特殊情况的处理：如果义务人未提出诉讼时效抗辩，法院不得主动适用诉讼时效的规定进行裁判。此时，若权利人的主张有事实和法律依据，法院仍会支持其诉讼请求。这体现了法律的公正性和灵活性。

三、实际应用中的具体情形

1. 被告提出时效抗辩且查证属实：

   • 在诉讼过程中，如果被告明确以诉讼时效已过为由进行抗辩，并且法院经审查确认诉讼时效确实已经过，同时不存在诉讼时效中止、中断或延长等法定情形，那么法院将判决驳回原告的诉讼请求。

2. 被告未提出时效抗辩：

   • 即使诉讼时效实际上已经过，但如果被告在诉讼中没有提出这一抗辩，法院将不会对诉讼时效问题进行主动审查，而是会按照案件的实体内容进行审理并作出相应判决。这种情况下，原告的诉讼请求有可能得到支持。

3. 存在特殊情况（诉讼时效中止、中断等）：

   • 如果存在诉讼时效中止、中断或延长等法定情形，即使表面上看似诉讼时效已经过，但实际上可能仍在有效的诉讼时效期间内。因此，法院在这种情况下不会以诉讼时效已过为由驳回原告的诉讼请求。

四、实际案例解析

案例：张三于2018年5月借给李四5万元，约定半年还款。2023年6月张三起诉要求还款，李四以超诉讼时效为由抗辩。

裁判结果：法院认定借款事实存在，但因超过3年诉讼时效且李四已行使抗辩权，最终判决驳回张三的诉讼请求。此案例中，法院既未否定借贷关系，也未因程序问题驳回起诉，而是通过实体审查作出裁判。

五、法律建议

1. 对于权利人：

   • 及时行使自己的权利，避免因为超过诉讼时效而丧失胜诉权。
   • 在起诉前，仔细审查诉讼时效问题，确保自己的权利仍在有效保护期内。

2. 对于义务人：

   • 积极履行自己的义务，避免因为时效问题而被追究法律责任。
   • 如果认为权利人的主张已超过诉讼时效，应及时提出抗辩，并准备相关证据支持自己的主张。

综上所述，超过诉讼时效时，法院应驳回诉讼请求而非驳回起诉。这一规定既体现了法律对原告诉权的尊重和保护，也体现了法律对公平正义的追求和维护。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。