针对您提出的关于个人小规模淡水养殖，在仅有土地租赁合同而非水域租赁合同的情况下需要办理什么手续才能进行水产养殖的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，根据新修订的《中华人民共和国渔业法》的相关规定，进行水产养殖，特别是利用国家、集体所有的水域滩涂进行养殖生产的，必须办理水域滩涂养殖证。这是行业准入的必备条件，明确了“无证不得养殖”的刚性约束。
办理水域滩涂养殖证的具体流程和要求如下：
准备申请材料：
- 您需要持有合法有效的水域、滩涂使用权证明。虽然您目前只有土地租赁合同，但关键在于这份合同是否涵盖了您计划用于养殖的水域滩涂部分，或者您是否能通过其他方式（如与水域所有者协商补充协议）获得水域滩涂的使用权证明。
- 提交公民个人身份证明。
- 填写《养殖证申请表》，详细说明您的养殖计划、养殖种类、养殖规模等信息。
提交申请：
- 将上述申请材料提交至县级以上地方人民政府渔业渔政主管部门。
审核与公示：
- 县级渔业行政主管部门在受理后15个工作日内对您的申请材料进行书面审查和实地核查。
- 符合规定的，将在水域、滩涂所在地进行公示，公示期为10日。
核发养殖证：
- 公示期满后无异议，且权属无争议，符合办证条件的，县级渔业行政主管部门将按程序核发水域滩涂养殖证给您。
额外注意事项：
- 如果您的土地租赁合同并不直接涵盖水域滩涂的使用权，您可能需要与水域的所有者或管理者进行协商，以获得必要的水域滩涂使用权证明或补充协议。
- 此外，如果您计划从事水产苗种生产活动，还应根据法律规定取得县级以上地方人民政府渔业渔政主管部门核发的水产苗种生产许可证（渔业生产者自育、自用水产苗种的除外）。
总结与建议：
- 您需要首先确认自己的土地租赁合同是否涵盖了养殖所需的水域滩涂部分，或者通过其他方式获得水域滩涂的使用权证明。
- 准备好所有必要的申请材料，并按照规定的流程向县级以上地方人民政府渔业渔政主管部门提交申请。
- 在等待审核和公示期间，保持与渔业行政主管部门的沟通，及时了解申请进度和可能需要的补充材料。
希望以上解答能对您有所帮助。如果您在办理过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时咨询当地的渔业行政主管部门或相关法律专业人士。