核心结论：若工伤医院的材料丢失，可按以下步骤处理，以最大程度保障自身权益：

1. 立即联系医院补办材料
   首先应第一时间联系就诊医院，说明材料丢失的情况，要求医院根据病历管理规定补办相关材料。根据《医疗机构病历管理规定》，医院有义务为患者提供病历复印或补办服务（需携带本人身份证原件）。若医院以各种理由推诿，可向当地卫生健康委员会投诉（投诉电话12320），要求协调处理。

2. 收集其他证据佐证工伤事实
   若医院无法补办全部材料，需尽快收集其他证据形成证据链，证明工伤事实及治疗过程。具体包括：

   • 同事证言：联系当时在场同事，请其出具书面证言（需签字按手印），证明受伤时间、地点及经过；
     
   • 现场监控：若单位或公共场所有监控，可要求单位或管理方提供监控录像（需注意保存期限，避免过期）；
     
   • 医疗费用凭证：保留所有治疗费用的发票、缴费记录、药品清单等，证明实际产生的医疗支出；
     
   • 诊断证明替代文件：若医院无法补办诊断证明，可要求主治医生出具书面说明（需加盖医院公章），或通过医院系统调取电子病历打印并盖章；
     
   • 工伤认定申请表：若已提交工伤认定申请，可联系社保部门复印留存的材料，作为辅助证据。

3. 及时申请工伤认定，避免超期
   根据《工伤保险条例》，工伤认定申请需在受伤后30日内由单位提出，单位未提出的，劳动者或其近亲属可在1年内直接向社保部门提出。材料丢失不影响工伤认定申请的时效，但需在申请时说明情况，并提交上述替代证据。若因材料缺失导致社保部门要求补充材料，需在规定期限内完成补充，避免因超期被驳回。

4. 若单位不配合，可依法维权
   若单位以材料丢失为由拒绝配合工伤认定或赔偿，劳动者可采取以下措施：

   • 向劳动监察大队投诉：拨打12333或通过当地人社局官网投诉，要求单位履行法定义务；
     
   • 申请劳动仲裁：若投诉无果，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张工伤待遇赔偿（需提交劳动合同、工资流水、工伤事实证据等）；
     
   • 提起诉讼：对仲裁结果不服的，可在15日内向法院起诉，通过司法程序维护权益。

温馨提示：工伤认定及赔偿涉及程序较多，建议优先通过补办材料、收集证据的方式完善申请，若过程中遇到困难，可随时向我咨询具体操作细节。