结论：私车公养3500元，在辞职后是否还会被处理，这主要取决于公司是否已经发现该行为、公司的规章制度以及相关法律法规的规定。以下从多个角度进行分析：
一、公司规章制度的角度
公司发现与处理：
- 如果公司在你辞职前已经发现了私车公养的行为，并且公司规章制度中有明确规定此类行为属于违纪或违法行为，那么公司有权依据规章制度对你进行处理，包括但不限于警告、罚款、解除劳动合同等。
- 如果公司在你辞职后才发现该行为，但公司规章制度中规定了对此类行为的追溯处理期限或方式，那么公司仍然有可能依据规章制度对你进行处理。
规章制度合法性：
- 公司的规章制度必须合法合规，且经过民主程序制定并公示，才能作为处理员工的依据。如果规章制度存在违法或不合理之处，那么公司依据该规章制度作出的处理决定可能无效。
二、法律法规的角度
职务侵占或贪污：
- 私车公养行为，如果涉及利用职务之便，将公司财产用于个人消费，且数额较大，可能构成职务侵占或贪污等违法行为。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，职务侵占或贪污数额较大的，可能面临刑事处罚。但在此案例中，3500元的数额是否构成“数额较大”，需根据当地的具体标准来判断。
- 即便数额未达到刑事处罚的标准，如果公司选择报警，公安机关也可能依据《中华人民共和国治安管理处罚法》等相关规定，对你进行行政处罚。
劳动法相关规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者应当遵守劳动纪律和职业道德，不得损害用人单位的利益。私车公养行为如果违反了这一原则，公司有权依据劳动法规定对你进行处理。
三、实际处理建议
主动沟通：
- 如果你意识到私车公养行为可能存在问题，建议主动与公司沟通，说明情况并表达歉意。如果公司尚未发现该行为，你的主动沟通可能有助于减轻或避免处理。
了解公司规章制度：
- 在沟通前，建议先了解公司的规章制度中关于私车公养等违纪行为的规定，以便更好地应对公司的处理决定。
寻求法律帮助：
- 如果公司对你进行了不合理的处理，或者你认为自己的权益受到了侵害，可以寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的权益。
进一步思考：私车公养行为不仅可能违反公司规章制度，还可能涉及法律法规的违反。因此，建议你在未来的工作中严格遵守公司规章制度和法律法规，避免类似行为的发生。如果你有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。