结论：在您描述的情况下，与国有企业签订的房屋使用权合同在被兼并后是否有效，主要取决于合同内容是否违反法律、行政法规的强制性规定，以及兼并过程中合同的承继情况。一般情况下，合同仍然有效，但具体还需根据合同条款和兼并的具体情况来判断。
详细分析：
合同效力的基本原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。这意味着，只要合同是依法成立的，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定，它就具有法律效力。
国有企业兼并对合同的影响：
- 国有企业被兼并后，其权利和义务通常由兼并后的企业承继。这包括与第三方签订的合同。因此，在您的情况下，如果房屋使用权合同是在国有企业被兼并前依法签订的，且合同内容不违反相关法律法规，那么该合同在兼并后仍然有效，兼并后的企业应当继续履行合同义务。
合同无效的特殊情况：
- 尽管一般情况下合同仍然有效，但也存在一些特殊情况可能导致合同无效。例如，如果合同内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者存在欺诈、胁迫等情形导致合同订立时意思表示不真实，那么合同可能被认定为无效。此外，如果兼并过程中存在违法违规行为，也可能影响合同的效力。
被起诉后的应对策略：
- 如果您因为房屋使用权合同被起诉，首先应当仔细审查合同条款和兼并过程中的相关文件，以确定合同是否仍然有效。如果合同有效，您应当积极应诉，提供相关证据证明您的权利。如果合同存在无效情形，您也需要根据具体情况制定相应的应对策略。
建议：
- 审查合同条款：仔细审查与国有企业签订的房屋使用权合同，确保合同内容合法、有效，并明确双方的权利和义务。
- 了解兼并情况：了解国有企业被兼并的具体情况，包括兼并协议的内容、兼并后的企业状况等，以便更好地判断合同的承继情况。
- 寻求法律帮助：如果您对合同的效力或应诉策略存在疑问，建议及时咨询专业律师，以便获得更具体的法律建议和帮助。
在处理此类法律问题时，每个案件的具体情况都可能有所不同。因此，如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。