当员工主动提出离职，但调休假还未用完时，公司应当依法处理这一情况，确保员工的合法权益得到保障。以下是对这一问题的详细解答：
一、法律依据与处理原则
根据《中华人民共和国劳动合同法》及《企业职工带薪年休假实施办法》等相关法律法规，员工有权享受带薪休假，包括调休假。在离职时，员工有权请求公司支付未休调休假对应的加班薪酬或进行补休。这一处理过程需同时遵循公司规章制度和法律法规的双重约束。
二、调休假的具体处理方式
安排补休：
- 如果员工在离职前还有未休完的调休假，公司应优先考虑安排员工在离职前的适当时间进行补休。这样既能确保员工享受应有的休息时间，也能减少公司的经济支出。
折算工资支付：
- 如果由于工作安排等原因无法安排补休，公司应按照法律规定折算工资支付给员工。具体支付标准根据加班类型有所不同：
- 周末加班：按员工个人平均每日或每小时工资标准的200%支付。
- 日常加班：按员工个人平均每日或每小时工资标准的150%支付。
- 法定节假日之外的调休假：通常按照正常工资标准支付。
- 未休年休假：根据员工当年实际工作时间计算出应享有的未休年休假天数，并以此为基础支付相应的补偿金。不足一整天的部分，一般无需支付补偿金。
三、员工如何维护自己的权益
与公司协商：
- 员工应首先尝试与公司的人力资源部门或上级领导进行友好沟通，明确指出根据法律规定和公司制度，自己应获得相应的工资补偿或补休。要求公司依法处理未休调休假的问题。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商不成，员工可以向当地的劳动监察部门投诉。投诉时需准备好相关证据，如劳动合同、考勤记录、工资条等，以证明自己的权益受到侵害。劳动监察部门将介入调查，并责令公司支付相应的工资或补偿。
申请劳动仲裁：
- 若劳动监察部门的处理未能解决问题，或者员工对处理结果不满意，还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁过程相对正式和严谨，仲裁结果具有法律效力。员工需提供充分的证据来支持自己的诉求。
四、注意事项
了解公司规定：
- 员工在离职前应提前了解公司对于主动离职时调休假的处理规定，以避免因误解而产生不必要的纠纷。
保留证据：
- 在整个过程中，员工应妥善保留所有与调休假相关的证据，如劳动合同、考勤记录、工资条、沟通记录等。这些证据将在需要时提供有力支持。
及时行动：
- 员工应在离职后合理的时间内提出调休假权益的主张，避免超过法律规定的时效期。及时行动有助于维护自己的合法权益。
综上所述，当员工主动提出离职但调休假还未用完时，公司应依法处理并支付相应的工资补偿或安排补休。员工也应积极了解自己的权益并采取措施维护自己的合法权益。