结论：公司扣除所有费用后工资为负数，一般情况下是不合法的。

法律分析：

1. 工资支付原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资是劳动者因提供劳动而应获得的报酬，用人单位应当按时足额支付。
   • 工资支付应当遵循诚实信用原则，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。

2. 扣除费用的限制：

   • 用人单位可以扣除劳动者工资的情况通常限于法定扣除（如个人所得税、社会保险费等）和约定扣除（如双方劳动合同中明确约定的扣除项目）。
   • 扣除的费用应当合理，且不得违反法律法规的强制性规定。例如，扣除的费用不得超过劳动者当月工资的20%（具体比例可能因地区和具体规定而异，但通常不会导致工资为负数），且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。

3. 工资为负数的合法性：

   • 如果公司扣除所有费用后工资为负数，这通常意味着扣除的费用超过了劳动者应得的工资，这违反了工资支付的原则和扣除费用的限制。
   • 在这种情况下，劳动者的合法权益受到了侵害，公司可能构成违法克扣工资。

法律建议：

1. 与公司协商：

   • 劳动者可以先与公司进行协商，要求公司说明扣除费用的具体项目和依据，并要求公司纠正违法的扣除行为。

2. 向劳动监察部门投诉：

   • 如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门介入调查并处理公司的违法行为。

3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：

   • 如果劳动监察部门的处理结果不满意，或者公司拒绝改正违法行为，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果公司被认定违法克扣工资，可能需要承担补发工资、支付赔偿金等法律责任。
• 劳动者也可能因此获得相应的经济补偿和法律救济。

举例说明：

假设某劳动者月工资为5000元，公司因某种原因扣除其费用共计6000元，导致劳动者当月工资为-1000元。这种情况下，公司的扣除行为显然违反了法律法规的规定，劳动者有权要求公司补发工资并支付相应的赔偿金。

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