公司无故扣除底薪部分是不合法的。
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条,工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人,不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。同时,《工资支付暂行规定》也明确指出,用人单位无权克扣劳动者的工资,除非存在法定可以扣除工资的情况,如代扣个人所得税、社保费用等,或者因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失,用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失,但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%,且扣除后的剩余工资部分不能低于当地月最低工资标准。
因此,如果公司没有上述法定理由就扣除员工的底薪,员工可以先尝试与公司进行协商。如果协商无果,员工可以向劳动监察部门进行投诉,或者申请劳动仲裁,以此来维护自己的合法权益。
总的来说,公司不能随意扣除员工的底薪,除非存在法定的扣除情形,并且需要遵守相关的法律规定和限制。如果你在这方面遇到了问题,可以直接向我咨询,我会为你提供专业的法律帮助。