结论：测绘公司仪器检定超过三天是否需要赔偿，这并非一个简单的“是”或“否”的问题，而是需要根据具体情况，包括合同约定、相关法律法规以及实际损失情况来综合判断。
分析角度一：合同约定
合同中有明确约定：如果测绘公司与委托方在合同中明确约定了仪器检定的时间限制，并且约定了超过该时间限制需要承担的赔偿责任，那么测绘公司就需要按照合同约定进行赔偿。
合同中无明确约定：如果合同中没有明确约定仪器检定的时间限制以及超过时间限制的赔偿责任，那么测绘公司是否需要赔偿就需要根据其他因素来判断。
分析角度二：相关法律法规
法律法规有规定：如果相关的法律法规对测绘仪器检定的时间有明确规定，并且测绘公司超过了该时间限制，同时给委托方造成了实际损失，那么测绘公司可能需要承担相应的赔偿责任。但这种情况通常较为少见，因为法律法规往往不会直接规定具体的检定时间，而是会规定一些原则性的要求。
法律法规无规定：如果法律法规没有明确规定测绘仪器检定的时间限制，那么就需要根据行业惯例、公平原则以及实际损失情况等因素来综合判断测绘公司是否需要赔偿。
分析角度三：实际损失情况
有实际损失：如果测绘公司仪器检定超过三天给委托方造成了实际损失，如工程延期、成本增加等，那么测绘公司可能需要承担相应的赔偿责任。赔偿的金额通常需要根据实际损失情况来确定。
无实际损失：如果测绘公司仪器检定超过三天并没有给委托方造成实际损失，或者损失非常轻微，那么测绘公司可能不需要承担赔偿责任，或者只需要承担很小的赔偿责任。
建议：
审查合同：首先，测绘公司和委托方都应该仔细审查合同中的相关条款，看是否有关于仪器检定时间和赔偿责任的明确约定。
协商解决：如果合同中没有明确约定，或者约定不明确，双方可以尝试通过协商来解决争议。在协商过程中，可以充分考虑行业惯例、公平原则以及实际损失情况等因素。
寻求法律途径：如果协商无果，双方可以考虑通过法律途径来解决争议。在这种情况下，建议咨询专业的建设工程律师，以便更好地维护自己的合法权益。
可能后果：
如果测绘公司需要承担赔偿责任，那么赔偿的金额将根据实际损失情况、合同约定以及相关法律法规等因素来确定。
如果测绘公司不需要承担赔偿责任，那么委托方可能需要自行承担因仪器检定超过三天而产生的额外费用或损失。
总之，测绘公司仪器检定超过三天是否需要赔偿，需要根据具体情况来综合判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。