针对您提出的“一直未签劳动合同，一年后补签劳动协议，二倍工资差额怎么算”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、计算依据与适用条件

根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十二条的规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。这是计算二倍工资差额的法律依据。

适用条件：

1. 时间范围：从用工满一个月的次日起，至补订书面劳动合同的前一日，或至劳动关系终止/解除的前一日（但最长不超过十一个月，因为自用工之日起满一年视为已订立无固定期限劳动合同）。

2. 排除情形：如果未签订劳动合同是由于劳动者的原因导致的，如劳动者拒绝签订，则用人单位不适用该规定，即不需要支付二倍工资差额。

二、具体计算方法

1. 计算基数：

   • 二倍工资差额的计算基数一般为劳动者的应得工资，这包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等货币性收入。
   • 不包含用人单位承担的社会保险费用、劳动保护费用等非工资性收入，以及支付周期超过一个月或未确定支付周期的劳动报酬（如季度奖、年终奖）及非货币性福利。
   • 若劳动者的月工资高于当地上年度职工月平均工资三倍的，按三倍数额支付；如当地有明确规定以基本工资为计算基数的，则依当地规定执行。

2. 计算公式：

   • 二倍工资差额 = (月工资总额 × 未签合同月数) - 已支付的工资
   • 需要注意的是，这里的“未签合同月数”是从用工满一个月的次日起算，至补订合同前一日或劳动关系终止前一日的月数，且最长不超过十一个月。

3. 示例：

   • 假设某员工月薪为5000元，工作9个月后补签劳动合同，且未签合同的原因不在劳动者一方。那么，该员工应得的二倍工资差额为：5000元 × (9-1) = 40000元（因为首月不需要支付二倍工资，所以计算的是后8个月的差额）。

三、特殊情形处理

1. 试用期未签合同：

   • 如果试用期未签劳动合同，用人单位同样需要支付二倍工资差额。但试用期工资不得低于约定工资的80%且不低于当地最低工资标准。

2. 合同期满后未续签：

   • 如果劳动合同期满后，用人单位继续用工但未续签劳动合同，同样需要支付二倍工资差额。

四、时效与仲裁注意事项

1. 仲裁时效：

   • 二倍工资差额属于惩罚性赔偿，适用一般仲裁时效，通常为一年。从劳动者知道或应当知道其权利被侵害之日起计算，具体起算点可能因地区而异。

2. 举证责任：

   • 劳动者需要提供存在劳动关系及未签合同的证据，如考勤记录、工资条、工作证等。
   • 用人单位则需要证明未签合同的责任在劳动者一方，如提供劳动者拒绝签订合同的书面证据等。

五、总结与建议

对于您的情况，如果一年后补签了劳动合同，且未签合同的原因不在劳动者一方，那么您可以根据上述方法计算应得的二倍工资差额，并通过劳动仲裁等法律途径维护自己的合法权益。同时，建议劳动者在入职时及时与用人单位签订书面劳动合同，以避免不必要的法律纠纷。用人单位也应加强劳动合同管理，确保及时与劳动者签订书面劳动合同，避免承担不必要的法律责任。