结论前置：旷工离职时工资的扣除数额并非固定，而是依据劳动合同、用人单位的规章制度以及相关法律法规综合确定。以下从不同角度为您详细分析：
一、劳动合同与规章制度中的规定
劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确规定了旷工离职的工资扣除标准，如“旷工一天扣发三日工资”或“旷工按日工资的200%扣除”等，那么用人单位有权按照这些约定执行扣款。但需注意，这些约定必须合法、合理，且不得违反法律法规的强制性规定。
规章制度规定：
- 用人单位通常会在《员工手册》或内部规章制度中规定旷工的处罚标准。若这些规定是通过合法程序制定、内容不违反法律法规且已向劳动者公示的，那么用人单位也有权按照这些规定执行扣款。
- 示例：假设某公司规章制度规定旷工一天扣发当日工资的50%，员工月工资为6000元，旷工两天，则扣除金额为6000元÷21.75天×2天×50%≈276元（按实际出勤天数计算日薪后扣除），剩余工资应不低于当地最低工资标准。
二、法律法规的限制
法定扣款上限：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 计算公式：若需扣除工资赔偿经济损失，则每月最多扣除金额 = 月工资 × 20%；扣除后实发工资 = 月工资 - 扣除金额（若扣除金额导致实发工资低于最低工资标准，则按最低工资标准支付）。
无经济损失时的限制：
- 若无直接经济损失，仅因旷工行为本身，用人单位无权全额扣除工资。例如，员工无故旷工但未影响项目进度或造成其他损失，单位最多可按制度扣除一定比例的绩效工资或旷工天数的工资，而非全部工资。
三、实际操作中的注意事项
证据留存：
- 用人单位需证明旷工事实，如考勤记录、催告通知等。若缺乏证据，可能被认定为违法解除劳动关系，需支付赔偿金。
协商优先：
- 实践中，用人单位与劳动者可通过协商解决旷工离职的工资扣除问题。例如，允许员工补假抵扣旷工天数，避免直接扣款引发的纠纷。
司法救济途径：
- 若劳动者对扣款有异议，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。法院在审理时会重点审查扣款是否合法合理，包括扣款依据是否充分、扣款数额是否适当等。
四、特殊情况的处理
未办理离职手续的影响：
- 如果员工旷工离职且未办理离职手续，用人单位可能会暂停发放工资，直到员工办理完离职手续。办理离职手续时，用人单位会按照上述计算方法结算员工的工资。
给用人单位造成损失的赔偿：
- 如果员工旷工行为给用人单位造成了经济损失，且劳动合同中有相关约定，用人单位可以要求员工赔偿。赔偿金额应从员工工资中扣除，但需遵循法律规定的扣款上限和最低工资标准。
总结与建议：旷工离职时工资的扣除是一个涉及多个法律知识点的复杂问题。作为劳动者，您应了解自己的合法权益，并在离职前与用人单位妥善协商处理相关事宜。若认为扣款不合理，应及时提出异议并寻求法律途径解决。作为用人单位，则应制定合法、合理的规章制度，并在执行扣款时严格遵守法律规定，以避免引发不必要的纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。