关于员工宿舍抽烟罚款是否合法的问题，这需要从多个角度进行综合分析。

首先，从法律依据与罚款性质来看，公司无权对员工进行罚款。罚款是行政处罚的一种形式，根据《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规，只能由国家行政机关或其授权的事业单位实施。企业作为民事主体，并不具备罚款的权力。罚款本质上是对个人财产的强制剥夺，必须有明确的法律依据，公司不能仅凭内部规章制度就对员工进行罚款，否则构成对员工财产权的非法侵犯。

其次，从公司规章制度的合法性角度考虑，公司可以制定规章制度来规范员工行为，包括禁止在宿舍吸烟等规定，但这些规章制度必须遵守法律法规，不能侵犯员工的合法权益。对于违反规章制度的员工，公司可以采取警告、批评教育、纪律处分等合理措施，但不能直接设定罚款。如果员工行为给公司造成实际损失，公司可以要求员工赔偿相应损失，但这与罚款是不同的概念。

再者，从员工权益保护的角度出发，如果员工认为公司的罚款行为侵害了自身权益，首先可以与公司进行沟通协商，要求其退还罚款。若协商不成，员工可以向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。

至于员工在宿舍抽烟本身是否违法，这并非一概而论。目前，我国没有统一的法律规定明确禁止在员工宿舍吸烟，但部分地方可能制定了控制吸烟的专门法规，将某些室内工作场所（包括员工宿舍）纳入禁烟范围。此外，根据《中华人民共和国消防法》，在具有火灾、爆炸危险的场所吸烟，情节严重的，可能会被处五日以下拘留。因此，如果员工宿舍属于这类特殊场所，吸烟将构成违法行为。

综合建议：

1. 公司应制定合法、合理的规章制度来规范员工行为，明确员工行为规范及相应的处罚措施，但这些措施不能侵犯员工的合法权益。
2. 公司可以通过宣传教育提高员工对规章制度的认识和遵守意识，增强他们的自律性。
3. 员工在宿舍抽烟前，应充分了解当地的法律法规和公司的内部规定，自觉遵守相关规定，共同维护一个健康、安全的工作和生活环境。
4. 如果员工因吸烟行为面临罚款或其他纪律处分，且认为这些处分不合法或不合理，应及时咨询专业律师以获取法律帮助。