员工离职三天并不一定构成自动离职，这主要取决于用人单位的规章制度、员工离职的具体原因，以及相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细分析：
公司规章制度的决定性作用
- 合法有效的规章制度：若公司的规章制度中明确规定了连续离职（或旷工）三天视为自动离职，并且该规定已经过民主程序制定（如经过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定），同时向劳动者进行了公示或告知，那么员工在无正当理由且未履行请假手续的情况下连续三天未上班，公司可以依据此规定认定员工自动离职。
- 规章制度的合法性审查：如果公司没有相关规定，或者虽有规定但制定过程不合法（如未经民主程序）、内容不合理（如对离职或旷工的界定过于严苛、惩罚与过错不相适应等），则公司不能仅凭连续三天未上班就认定员工自动离职。此时，公司应依据其他法律法规或劳动合同约定来处理员工的离职问题。
员工离职原因的考量
- 正当理由：若员工因不可抗力（如自然灾害、突发疾病等）或其他正当理由（如家中突发重大变故需紧急处理等）导致连续三天无法上班，并在事后及时向公司说明情况并提供相关证明，那么一般不应认定为自动离职。员工应保留好相关证据，以便在需要时向公司出示。
- 无故离职：如果员工没有任何正当理由，也未履行请假手续，连续三天无故不上班，且公司的规章制度中有合法有效的自动离职规定，那么公司可以依据规定认定员工自动离职。
法律后果与处理
- 离职手续与工资结算：即使员工被认定为自动离职，用人单位也应按照法律规定妥善处理好相关手续及工资结算等问题。例如，要结清员工在职期间的工资，不能随意克扣。这是保障员工合法权益的重要一环。
- 经济损失赔偿：若员工离职给单位造成经济损失，员工需承担赔偿责任。但单位在从员工工资中扣除赔偿金时，应遵守法律规定，每月扣除部分不得超过工资的20%，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，用人单位可以解除劳动合同的情形之一包括劳动者严重违反用人单位的规章制度。因此，如果员工离职行为被认定为严重违反公司规章制度，公司有权解除劳动合同。但这一解除必须基于合法有效的规章制度，并且该规章制度已经向员工进行了公示或告知。
- 同时，该法也保护了员工的合法权益。如果员工离职是因为公司未按照劳动合同约定提供劳动条件、未及时足额支付劳动报酬或未依法为劳动者缴纳社会保险费等情形，员工可以解除劳动合同，并有权要求公司支付经济补偿金。
建议与注意事项：
- 在处理员工离职问题时，公司应先与员工进行沟通，了解离职的具体原因，并尽可能通过协商解决问题。
- 员工也应了解自己的权利和义务，避免因误解或疏忽而遭受不必要的损失。如果员工对公司的离职处理有异议，可以通过劳动仲裁等方式维护自身权益。
- 无论何种情况，公司都应遵循法律规定，确保处理过程的合法性和合规性。
综上所述，员工离职三天是否算自动离职是一个复杂的问题，需要综合考虑公司的规章制度、员工离职的原因以及相关法律法规的规定。如果你或你所在的公司面临此类问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。