结论：农村房子之前没办房产证，现在因位于红绿灯管控线内而不给确权，这一做法是否合法合规，需结合具体情况及相关法律法规来判断。以下从多个角度进行分析：

1. 红绿灯管控线与确权的关系：

   • 红绿灯管控线通常是为了交通管理、安全或城市规划等目的而设定的区域限制。这一限制本身并不直接决定房屋是否可以确权。
   • 房屋确权主要依据的是土地管理法、房地产管理法等相关法律法规，以及地方政府的政策规定。因此，仅凭房屋位于红绿灯管控线内，并不能直接得出不能确权的结论。

2. 未办理房产证的情况：

   • 如果房屋之前未办理房产证，这可能涉及到历史遗留问题、土地权属争议或未按照法定程序进行建设等多种原因。
   • 在这种情况下，确权过程可能会更加复杂，需要相关部门进行详细的调查和核实，以确定房屋的合法性和权属关系。

3. 合法合规性的判断：

   • 如果当地政府或相关部门有明确的政策规定，指出位于红绿灯管控线内的房屋不得确权，且这一政策规定符合上位法（如土地管理法、房地产管理法等）的规定，那么这一做法可能是合法合规的。
   • 然而，如果政策规定缺乏明确的法律依据，或者与上位法相冲突，那么这一做法就可能存在合法性问题。

4. 建议与行动：

   • 了解具体政策：首先，建议您了解当地政府或相关部门关于房屋确权的具体政策规定，特别是关于红绿灯管控线内房屋确权的相关条款。
   • 咨询相关部门：如果您对政策规定有疑问或不解，可以咨询当地土地管理部门、房地产管理部门或法律援助机构等，以获取更准确的解释和指导。
   • 寻求法律帮助：如果您认为自己的权益受到了侵害，或者认为相关部门的做法存在合法性问题，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。

可能涉及的法律后果：

• 如果房屋确权被拒绝，且您认为这一决定不合法或不合理，您可能会面临无法证明房屋权属、无法进行房屋交易或继承等法律后果。
• 在极端情况下，如果房屋被认定为违法建设或存在权属争议，您还可能面临房屋被拆除或没收等风险。

进一步思考：

• 在处理此类问题时，除了关注法律层面的规定外，还应考虑当地的社会经济环境、政策导向以及实际执行情况等因素。
• 同时，保持与相关部门的良好沟通也是解决问题的关键。通过积极沟通，您可以更好地了解政策意图和执行标准，从而为自己的权益争取更多的保障。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。