结论：在挪用公款100万炒股获利500万的案例中，100万本金之所以不属于违法所得，是因为违法所得通常指的是通过违法行为直接获得的额外收益或利润，而不包括最初投入的违法资金本身。

详细分析：

1. 违法所得的定义：

   • 违法所得是指行为人通过违法行为直接获得的财产性利益。在挪用公款的情境中，违法所得通常指的是挪用公款后产生的利息、投资收益等超出本金的部分。

2. 本金与违法所得的区别：

   • 本金是行为人最初投入的资金，即挪用的100万公款。这部分资金虽然是通过违法行为获取的，但其本身并不构成违法所得，而是违法行为的对象或工具。
   • 违法所得则是基于这笔本金通过违法行为（如炒股）获得的额外收益，即500万中的超出100万本金的部分（若严格计算，需扣除合法交易成本等，但此处为简化说明，暂不考虑）。然而，在实际操作中，由于炒股等投资行为本身具有风险性，且违法所得的计算可能涉及复杂的财务和法律问题，因此通常不会简单地将全部收益视为违法所得，而是会根据具体情况进行判定。但无论如何，本金100万本身都不属于违法所得的范畴。

3. 法律后果与追缴：

   • 对于挪用公款的行为，法律会追究行为人的刑事责任，并可能要求其返还挪用的公款。
   • 同时，对于通过违法行为获得的违法所得，法律也会予以追缴，并上缴国库。但追缴的对象是违法所得，即超出本金的部分（在扣除合法成本后），而不包括本金本身。当然，如果本金已经因违法行为而遭受损失（如炒股亏损），则可能无法全额追缴，但行为人仍需承担刑事责任。

4. 特殊情况下的考虑：

   • 在某些特殊情况下，如果本金已经与违法所得混合在一起，难以区分，或者本金本身也因违法行为而产生了增值（如通过挪用公款进行的非法交易获得了额外利益），则可能需要根据具体情况对本金和违法所得进行综合判定和处理。但这种情况并不改变本金本身不属于违法所得的基本原则。

建议与后续行动：

• 如果您或您身边的人涉及此类案件，建议立即咨询专业律师，以便更准确地了解法律后果和应对策略。
• 在处理此类案件时，应积极配合司法机关的调查和审判工作，如实陈述事实，提供相关证据，以便司法机关能够准确判定违法所得的范围和金额。
• 同时，也应关注自身权益的保护，确保在追缴违法所得的过程中不受到不公正的待遇或损失。