试用期三个月被公司开除后，保密协议依然有效。以下是对这一问题的详细分析：

一、保密协议的法律性质与效力

1. 独立于劳动关系：保密协议是用人单位与劳动者之间为保护商业秘密、知识产权等敏感信息而达成的特殊约定。其法律效力并不依赖于劳动关系的存续状态，即使劳动关系在试用期内解除，保密义务仍然持续存在。
2. 基于诚信与公平原则：根据商业道德和法律的公平、诚信原则，劳动者在知悉用人单位的商业秘密后，无论劳动关系因何原因结束，都应承担不泄露这些信息的义务。
3. 法律明确规定：《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条明确认可了保密协议的合法性和有效性，并未限定其仅在劳动关系存续期间有效。

二、保密协议的内容与适用范围

1. 合法性：保密协议的内容必须符合法律规定，不得违反法律法规的强制性规定。例如，协议中不得约定不合理的保密期限或过高的违约金。
2. 明确性：协议应明确保密范围、保密主体、保密期限以及违约情形和法律责任等关键条款，以确保双方权益清晰。这有助于劳动者明确自己的保密义务，也便于用人单位在劳动者违反保密协议时追究其法律责任。
3. 适用范围广泛：对于从事重要工作岗位或掌握商业秘密的员工，无论是否处于试用期，用人单位通常都会要求签订保密协议。这是为了保护用人单位的商业利益不受损害。

三、特殊情况下的保密协议效力

1. 协议无效情形：如果保密协议存在欺诈、胁迫等导致合同无效的情形，或者协议内容本身违法（如约定不合理的保密期限或过高的违约金），那么该协议自始无效，劳动者无需遵守。但这种情况较为少见，且需要劳动者提供充分的证据来证明协议无效。
2. 合理限制：保密协议应仅针对真正的商业秘密和敏感信息进行保护，不应过度限制劳动者的合法权益。例如，协议中不得约定劳动者在离职后不得从事与原用人单位有竞争关系的工作（这属于竞业限制条款，需要单独约定并支付经济补偿）。

四、法律建议

1. 仔细阅读保密协议：在离职前，建议劳动者仔细阅读保密协议的相关条款，特别是保密范围、保密期限、违约责任等关键内容。这有助于劳动者明确自己的保密义务，避免在离职后因违反保密协议而面临法律纠纷。
2. 咨询专业意见：如果劳动者对保密协议的内容存在疑问或不确定自己的保密义务，可以向专业律师咨询。作为专业律师，我可以为你提供详细的法律解释和建议，帮助你更好地理解和遵守保密协议。
3. 遵守保密义务：无论劳动关系因何原因结束，劳动者都应严格遵守保密协议中的各项义务。这不仅是法律的要求，也是商业道德和职业操守的体现。

总结来说，试用期三个月被公司开除后，保密协议依然有效。劳动者应严格遵守保密协议中的各项义务，以保护用人单位的商业秘密和知识产权。同时，用人单位也应确保保密协议的合法性和合理性，避免侵犯劳动者的合法权益。如果你对保密协议的内容存在疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。