工作合同签了保密协议是有效的。保密协议具有相对独立性，其效力并不依赖于劳动合同的存在。无论是否签订劳动合同，只要双方就保密事项达成一致，并签订书面协议，该协议即具备法律效力。以下是对这一结论的详细解释：

1. 保密协议的独立性与有效性：

   • 保密协议是基于用人单位对商业秘密等知识产权的保护需求，以及劳动者对知悉的商业秘密负有保密义务而订立的。
   • 《劳动合同法》第二十三条明确规定，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项，这为保密协议的签订提供了明确的法律依据。

2. 保密协议的内容与要素：

   • 保密协议应具备明确性，包括明确的当事人、保密事项、保密期限、违约责任等要素。
   • 保密协议的内容必须合法，不得违反法律法规的强制性规定，也不得损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。

3. 保密协议的约束力与责任：

   • 一旦保密协议生效，双方均需严格按照协议约定履行保密义务。
   • 对于违反保密协议的行为，违约方需承担相应的法律责任，包括但不限于民事责任、行政责任甚至刑事责任。

4. 特殊情况下的考虑：

   • 如果双方虽未签订书面劳动合同，但已形成事实劳动关系，那么在此基础上签订的保密协议仍然有效。
   • 如果保密协议存在内容不明确、违反法律法规强制性规定、存在欺诈胁迫等导致合同无效的情形，那么该保密协议将被视为无效。

综上所述，工作合同中签订的保密协议是有效的，对双方均具有法律约束力。如果关于保密协议的具体内容或执行过程中有任何疑问或争议，建议直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。