结论：在此情况下，责任归属需根据具体情形来判断，但一般来说，如果商家未经消费者同意擅自剥开榴莲，商家应承担相应责任。
分析：
合同关系角度：
- 消费者在购买榴莲时，明确备注了“不要剥开，要整个的”，这构成了消费者与商家之间的买卖合同的一部分内容，即消费者对榴莲的交付形式有特定要求。
- 商家作为卖方，有义务按照消费者的要求交付商品。如果商家未经消费者同意擅自剥开榴莲，则违反了合同约定，应承担违约责任。
消费者权益保护角度：
- 根据《中华人民共和国消费者权益保护法》的相关规定，消费者在购买商品时享有知情权、选择权、公平交易权等权益。
- 商家未经消费者同意剥开榴莲，可能侵犯了消费者的选择权（消费者原本选择的是整个榴莲，而非剥开的榴莲）和公平交易权（消费者可能因榴莲被剥开而对其价值产生质疑，觉得交易不公平）。
实际操作与行业惯例角度：
- 在实际操作中，商家应尊重消费者的意愿，按照消费者的要求提供商品。如果商家因操作失误或故意行为导致榴莲被剥开，应主动与消费者沟通，寻求解决方案，如更换商品、退款或给予适当补偿。
- 从行业惯例来看，商家在销售水果等商品时，通常会尊重消费者的选择，提供符合消费者要求的商品形式。
建议：
- 如果您作为消费者遇到了这种情况，首先应与商家沟通，说明您的要求并寻求解决方案。
- 如果商家拒绝承担责任或解决方案不满意，您可以考虑向消费者协会投诉或寻求法律途径解决纠纷。
- 在未来购物时，建议您在备注或与商家沟通时更加明确和详细地说明您的要求，以避免类似纠纷的发生。
可能后果：
- 如果商家承认错误并愿意承担责任，您可能会获得更换商品、退款或适当补偿等解决方案。
- 如果商家拒绝承担责任且双方无法协商解决，您可能需要通过法律途径来维护自己的权益，这可能会涉及诉讼费用和时间成本等。因此，在采取法律行动前，请务必权衡利弊并考虑实际情况。