旅行社与汽车运输公司签订包车协议，双方形成的是运输合同法律关系。以下从多个角度对此法律关系进行详细分析：
一、法律关系的主体与客体
主体：
- 旅行社：作为包车协议的一方，通常是旅游服务的提供者，需要运输服务来支持其旅游业务的开展。
- 汽车运输公司：作为包车协议的另一方，是提供运输服务的专业机构，拥有符合运输要求的车辆和驾驶员。
客体：
- 运输服务：即汽车运输公司按照包车协议的约定，为旅行社提供指定时间、地点的旅客运输服务。
二、法律关系的内容
权利与义务：
- 旅行社的权利：要求汽车运输公司按照协议约定的时间、地点、车辆类型等提供运输服务；在运输过程中，有权要求汽车运输公司保障旅客的安全和舒适。
- 旅行社的义务：按照协议约定支付运输费用；提供准确的旅客信息和运输需求；在运输过程中，配合汽车运输公司的工作，确保运输的顺利进行。
- 汽车运输公司的权利：按照协议约定收取运输费用；在旅行社违反协议约定时，有权要求旅行社承担违约责任。
- 汽车运输公司的义务：按照协议约定的时间、地点、车辆类型等提供运输服务；确保车辆的安全性能符合国家标准，驾驶员具备相应的驾驶资格和经验；在运输过程中，保障旅客的安全和舒适，及时处理运输过程中出现的问题。
违约责任：
- 若旅行社未按照协议约定支付运输费用或提供准确的旅客信息和运输需求，导致汽车运输公司无法正常提供运输服务，旅行社应承担违约责任，包括支付违约金、赔偿损失等。
- 若汽车运输公司未按照协议约定提供运输服务，如迟到、车辆故障、驾驶员服务态度恶劣等，导致旅行社的旅游业务受到影响，汽车运输公司应承担违约责任，包括退还部分或全部运输费用、支付违约金、赔偿损失等。
三、法律关系的适用法律
《中华人民共和国民法典》：
- 包车协议作为一种民事合同，其订立、履行、变更和终止等均应遵循《民法典》中关于合同的相关规定。
- 特别是《民法典》中关于运输合同的规定，如第八百零九条至第八百三十三条，详细规定了运输合同中双方的权利义务、违约责任等，是处理包车协议纠纷的重要法律依据。
其他相关法律法规：
- 如《中华人民共和国道路运输条例》等，对道路运输经营者的资质、车辆安全性能、驾驶员资格等方面进行了规定，也是处理包车协议纠纷时需要考虑的法律法规。
四、实际案例中的法律关系分析
在实际案例中，旅行社与汽车运输公司签订包车协议后，若因一方违约导致纠纷，法院会根据协议的具体内容、双方的履行情况、违约的严重程度等因素，综合判断双方的责任承担。例如，若因汽车运输公司车辆故障导致旅行社旅游业务取消，法院可能会判决汽车运输公司退还运输费用并支付一定的违约金或赔偿损失。
建议：在签订包车协议时，双方应明确约定各自的权利义务、违约责任等条款，以避免纠纷的发生。若发生纠纷，应及时收集证据并寻求法律途径解决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。