运输公司与司机签订的车辆合作协议是否属于劳动关系，主要取决于双方之间的实际合作模式、管理程度以及经济依赖等因素。以下是对此问题的详细分析：
一、构成劳动关系的情形
合同形式与内容：
- 如果运输公司与司机签订的是正式的劳动合同，且合同中明确约定了工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬等条款，这通常表明双方之间构成劳动关系。
管理程度：
- 运输公司为司机提供了运输工具（如货车），并负责车辆的保养、维修和保险等费用。
- 司机需要按照运输公司的规定进行工作，包括遵守公司的工作时间、路线规划、装卸货物等要求。
- 在这种合作模式下，司机对运输公司具有人格和经济上的从属性，即司机在劳动过程中需要服从运输公司的安排和管理，且其经济收入主要来源于运输公司支付的工资。
经济依赖：
- 司机的经济收入主要或完全依赖于运输公司支付的报酬，这表明司机对运输公司存在经济上的依赖。
二、构成劳务关系的情形
合同形式与内容：
- 如果运输公司与司机签订的是车辆合作协议，且协议中并未明确约定双方构成劳动关系，而是约定了司机以自有车辆为运输公司提供运输服务，并按照运输的次数、里程或货物的重量来结算报酬，这更可能构成劳务关系。
自主性与独立性：
- 司机在工作中具有较大的自主性，如自行安排工作时间、路线等。
- 司机并不完全依赖于运输公司提供的运输任务，可能同时为多家运输公司提供服务。
经济关系：
- 司机与运输公司之间的经济关系更侧重于一次性的或特定的劳动服务交易，而非持续性的劳动关系。
三、法律建议
明确合同性质：
- 运输公司在与司机签订合同时，应明确合同的性质，是劳动合同还是劳务合同，以避免后续的法律纠纷。
完善合同条款：
- 无论是劳动合同还是劳务合同，都应详细列明双方的权利和义务，包括工作内容、工作时间、劳动报酬、社会保险等条款，以确保合同的合法性和有效性。
遵守法律法规：
- 运输公司应遵守国家法律法规的规定，不得违反强制性规定或损害社会公共利益。例如，如果构成劳动关系，运输公司应为司机缴纳社会保险等费用。
咨询与审查：
- 在签订合同前，建议运输公司咨询专业律师或法律机构，以确保合同的合法性和有效性。同时，双方应详细审查合同内容，确保其合法性和合理性。
总结来说，运输公司与司机签订的车辆合作协议是否属于劳动关系，需要根据双方之间的实际合作模式、管理程度以及经济依赖等因素进行综合判断。如果构成劳动关系，运输公司应遵守相关法律法规的规定，保障司机的合法权益；如果构成劳务关系，双方也应明确各自的权利和义务，以避免后续的法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。