结论：物业扣留保管开发商的住宅质量保证书和住宅使用说明书一般是不合法的，除非存在特殊约定或法定情形。

分析如下：

1. 从合同关系角度：

   • 住宅质量保证书和住宅使用说明书是开发商在交付房屋时应当向购房者提供的法定文件，它们构成了购房合同的一部分，是购房者了解房屋质量和使用方法的重要依据。
   • 购房者与开发商之间存在购房合同关系，而物业公司与购房者之间则存在物业服务合同关系。这两种合同关系是独立的，除非在物业服务合同中有特别约定，否则物业公司无权扣留或保管这些文件。

2. 从法律规定角度：

   • 根据相关法律法规，开发商有义务在交付房屋时向购房者提供住宅质量保证书和住宅使用说明书。这些文件是购房者的合法权益，购房者有权要求开发商提供并自行保管。
   • 物业公司作为服务提供者，其职责是提供物业服务，如维护公共设施、管理小区秩序等，而非保管购房者的个人文件。除非得到购房者的明确授权或存在其他法定情形，否则物业公司无权扣留这些文件。

3. 从实际操作角度：

   • 如果物业公司扣留了这些文件，购房者可以首先与物业公司沟通，要求其归还。如果物业公司拒绝归还，购房者可以向开发商反映情况，要求开发商协助解决。
   • 若开发商和物业公司均不配合，购房者还可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益，如向法院提起诉讼或向相关行政部门投诉。

特殊情况说明：

• 如果在物业服务合同中有特别约定，如购房者同意将某些文件交由物业公司保管，或者存在其他法定情形（如法院判决、政府要求等），则物业公司扣留保管这些文件可能是合法的。但这种情况较为罕见，且需要明确的法律依据或合同约定。

建议：

• 购房者在接收房屋时，应仔细检查开发商提供的文件是否齐全，包括住宅质量保证书和住宅使用说明书等。
• 如果发现物业公司扣留了这些文件，购房者应及时与物业公司沟通并要求归还，必要时可寻求法律帮助。

如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。