在公司破产清算时，补偿给在职员工和已离职员工的顺序并无明确先后之分，均按照法定清偿顺序统一进行。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与清偿顺序
根据《中华人民共和国企业破产法》第一百一十三条的明确规定，破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，需依照以下顺序进行清偿：
职工债权：这包括破产人所欠职工的工资、医疗、伤残补助、抚恤费用，以及应划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用和法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金。此部分清偿不区分在职与已离职员工，所有符合条件的员工均享有同等的清偿权利。
社会保险费用和税款：在清偿完职工债权之后，破产人需继续清偿欠缴的除前款规定以外的社会保险费用和所欠税款。
普通破产债权：最后，剩余的破产财产将用于清偿普通的破产债权。
二、具体情况分析
在实际操作中，无论是在职员工还是已离职员工，只要其劳动债权符合上述法律规定的范围，都将被纳入同一清偿顺位。管理人会负责调查和公示职工债权，确认每位符合条件的员工应得的补偿金额，并严格按照法定的清偿顺序进行分配。
若破产财产足够：所有员工的劳动债权将得到足额支付，无论是在职还是已离职员工，都能按照其应得的补偿金额获得全额补偿。
若破产财产不足以清偿同一顺序的所有债权：则将按照各自应得金额的比例进行分配。这一机制确保了所有员工，无论在职与否，都能在法律框架内获得公平合理的补偿，避免了因财产不足而导致的部分员工无法获得补偿的情况。
三、特殊情况说明
虽然法律上并未明确区分在职员工和已离职员工的清偿顺序，但在实际操作中，仍需注意以下特殊情况：
已离职员工是否享有补偿权：通常，已离职的员工在劳动关系终止后，不再属于企业的在职员工范畴，因此不符合领取因企业破产而解除劳动合同的经济补偿金的条件。但是，如果员工在离职前已经与企业就经济补偿问题达成了协议，并且该协议中明确规定了即使员工离职后也能获得一定的补偿，那么员工可以依据协议要求企业履行支付义务。
在职员工与已离职员工补偿的差异性：尽管在职员工和已离职员工在清偿顺序上并无差异，但在具体补偿金额上可能存在不同。例如，在职员工可能因工作年限、工资水平等因素而获得更高的补偿金额；而已离职员工则可能因其离职时的具体情况（如是否因企业原因被迫离职）而影响其补偿金额。
总结与建议：
公司破产清算时，无需担忧在职员工与已离职员工的补偿顺序问题，因为法律已经明确规定了统一的清偿顺序和分配原则。然而，在实际操作中，仍需根据具体情况进行细致分析，以确保所有员工的合法权益得到充分保障。如果您或您所在的企业面临此类问题，建议及时咨询专业律师，以便更准确地了解自身权益和应对策略。