结论：行政复议普通程序审理的案件，若未听取申请人的意见，其合法性需结合具体案件情况、法律规定以及程序正当性原则来综合认定。在特定情况下，书面审理是合法的；但在当事人提出要求或行政复议机关认为必要时，应当听取当事人意见，否则可能构成程序违法。

详细分析：

1. 法律规定：

   • 根据《中华人民共和国行政复议法》第二十二条，行政复议原则上采取书面审查的办法。这意味着，在一般情况下，行政复议机关可以通过审查书面材料来作出复议决定。
   • 新修订的《中华人民共和国行政复议法》第四十九条进一步规定，适用普通程序审理的行政复议案件，行政复议机构应当当面或者通过互联网、电话等方式听取当事人的意见，并将听取的意见记录在案。若因当事人原因不能听取意见的，可以书面审理。

2. 合法情形：

   • 当案件事实清楚、证据确凿、适用依据明确，且各方对事实和法律问题争议不大时，行政复议机关可以仅通过书面材料进行审理，以提高行政效率。
   • 在普通程序审理中，如果当事人没有提出听取意见的要求，或者因当事人原因无法听取其意见（如当事人拒绝配合、无法联系等），行政复议机关进行书面审理是合法的。

3. 不合法情形：

   • 如果申请人提出要求听取意见，或者行政复议机关负责法制工作的机构认为有必要听取意见，而行政复议机关未听取相关意见，直接进行书面审理并作出决定，则违反了法定程序，属于不合法的情形。
   • 在普通程序审理中，若行政复议机关未按照法律规定听取当事人意见，也构成程序违法。这种程序违法可能导致行政行为被撤销或确认违法。

4. 程序违法的后果：

   • 当事人可以以此为由向人民法院提起行政诉讼，请求撤销该复议决定。人民法院在审理过程中，若发现复议决定存在程序违法情形，有权依法撤销该决定。

实务建议：

• 严格遵守法律规定：行政复议机关在办理案件时，应严格遵守《行政复议法》及相关法律法规的规定，确保程序的合法性和正当性。
• 保障当事人权利：行政复议机关应当充分保障当事人的陈述和申辩权利。在普通程序审理中，应主动与当事人沟通，了解其意见和诉求，并在必要时采取适当方式听取当事人意见。
• 提高办案效率：在确保程序合法的前提下，行政复议机关应努力提高办案效率，为当事人提供便捷、高效的行政复议服务。同时，也应积极探索和利用现代科技手段，如互联网、电话等，为当事人提供更加便利的听取意见渠道。

总结：行政复议普通程序审理的案件，若未听取申请人的意见，其合法性需根据具体情况来判断。行政复议机关在实务操作中应严格遵守法律规定和程序正当性原则，确保当事人的合法权益得到充分保障。若您在行政复议过程中遇到相关问题，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。