在交通事故中，交强险和商业险赔偿完毕后仍有不足部分的，车主和挂靠公司是否共同赔偿需分情况讨论：

1. 若车主与挂靠公司存在挂靠关系，且挂靠协议明确约定责任承担方式
   根据《民法典》第1211条，若挂靠协议明确约定事故责任由车主承担，或挂靠公司仅收取管理费不参与经营，实践中法院可能根据协议内容判定责任主体。但需注意：

   • 若挂靠公司存在过错（如未尽到安全管理义务），仍可能被要求承担补充责任；
     
   • 协议约定不得对抗第三人（受害者），受害者可直接要求车主与挂靠公司承担连带责任。

2. 若车主与挂靠公司无明确协议，或协议无效
   根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第3条，挂靠人与被挂靠人需承担连带赔偿责任。例如：

   • 车主以挂靠公司名义运营，挂靠公司收取管理费并参与管理，此时双方被视为共同经营主体；
     
   • 受害者可同时起诉车主和挂靠公司，要求二者共同赔偿不足部分，法院支持概率较高。

3. 特殊情形：挂靠公司无过错时的责任豁免
   若挂靠公司能证明已履行以下义务，可能免除或减轻责任：

   • 定期检查车辆安全性能；
     
   • 督促车主购买足额保险；
     
   • 对车主的驾驶资质进行审核。
     但实践中，挂靠公司通常需承担一定管理责任，完全免责案例较少。

建议行动：

• 若您是受害者，可同时起诉车主和挂靠公司，并申请财产保全以确保执行；
  
• 若您是车主或挂靠公司，需审查挂靠协议条款，并收集安全管理证据以抗辩；
  
• 具体责任比例需结合事故原因、挂靠协议内容、双方过错程度综合判定，建议提供详细案情进一步分析。