结论：针对您的情况，是否起诉公司还是出纳，需根据具体证据和事实情况来判断。一般来说，如果借款行为是您与公司之间的法律关系，且出纳是代表公司收款，那么您应当起诉公司；如果出纳个人收取了您的还款且未上交公司，且您能证明这一点，那么您可能还需要考虑对出纳采取法律措施，但主要责任方仍可能是公司，具体分析如下。

一、借款关系的法律主体

1. 借款合同关系：首先，要明确您与公司之间的借款关系。通常，借款合同是您与公司之间签订的，明确了借款金额、还款期限等条款。因此，从法律上讲，您与公司是借款合同的双方当事人。

2. 出纳的角色：出纳作为公司的员工，其收款行为通常是代表公司进行的。除非有特别约定或出纳明确表示其个人收款，否则一般应视为公司收款。

二、还款事实的证明

1. 还款凭证：您提到钱已还给出纳，但需要证明这一点。这通常需要提供还款的凭证，如转账记录、收据等。如果这些凭证上明确显示了出纳代表公司收款，那么这将对您非常有利。

2. 公司不认的情况：如果公司不承认您已经还款，您需要提供充分的证据来证明还款事实。这可能包括与出纳的沟通记录、其他员工的证言等。

三、起诉对象的选择

1. 起诉公司：

   • 如果借款合同是您与公司签订的，且出纳是代表公司收款，那么您应当起诉公司。在诉讼中，您需要提供借款合同、还款凭证等证据来证明您的主张。
   • 如果公司确实未收到您的还款，但由于出纳的失误或故意行为导致，这仍然是公司内部管理问题，不影响您与公司之间的借款关系。您仍有权要求公司确认还款事实或退还多收的款项（如果存在的话）。

2. 考虑出纳的责任：

   • 如果出纳个人收取了您的还款且未上交公司，且您能证明这一点（如出纳出具的收据、转账记录到出纳个人账户等），那么出纳可能构成不当得利或侵占公司财产。
   • 在这种情况下，您可能需要先与公司沟通，要求公司确认还款事实或采取其他措施。如果公司不配合，您也可以考虑对出纳提起诉讼，但主要责任方仍可能是公司，因为借款合同是您与公司之间的法律关系。

四、法律建议

1. 收集证据：首先，您需要收集所有与借款和还款相关的证据，包括借款合同、还款凭证、与出纳的沟通记录等。

2. 与公司沟通：在采取法律行动之前，建议您先与公司进行沟通，尝试通过协商解决问题。这可能包括要求公司确认还款事实、退还多收的款项或采取其他补救措施。

3. 咨询律师：如果沟通无果或您不确定如何处理这种情况，建议您咨询专业律师。律师可以根据您的具体情况和证据情况，为您提供更具体的法律建议和诉讼策略。

五、可能的法律后果

1. 如果起诉公司并胜诉：法院可能会判决公司确认还款事实或退还多收的款项（如果存在的话）。如果公司不履行判决，您还可以申请强制执行。

2. 如果起诉出纳并胜诉：法院可能会判决出纳返还不当得利或赔偿公司损失（如果出纳的行为构成侵占公司财产）。但这并不影响您与公司之间的借款关系，您可能仍需要与公司解决借款合同的后续问题。

总之，针对您的情况，是否起诉公司还是出纳需根据具体证据和事实情况来判断。建议您先收集证据、与公司沟通，并在必要时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。