针对您提出的“部委的人考上研究生没有提前报备，现在人事司不允许补，是否合法”的问题，我们需要从多个角度进行分析。

首先，我们要明确的是，部委工作人员的行为，包括在职深造、报备等，通常都受到严格的组织人事纪律和规定的约束。这些规定旨在确保公职人员的行为符合公共利益和组织要求，维护组织的正常运转和公信力。

1. 关于报备制度：

   • 在许多组织中，特别是政府部门和大型企事业单位，员工在职深造（如攻读研究生）通常需要提前向组织报备。这是为了确保组织能够合理安排工作，避免因员工深造而影响工作进度或质量。
   • 报备制度也是组织对员工行为的一种监督和管理方式，有助于维护组织的纪律性和秩序。

2. 关于人事司的决定：

   • 人事司作为负责人事管理的部门，其决定通常基于组织的规定和纪律要求。如果人事司不允许补报备，这很可能是基于组织内部的规章制度或上级指示。
   • 在没有提前报备的情况下，人事司可能认为该员工的行为违反了组织的规定，因此拒绝补报备是合理的。

3. 关于合法性：

   • 从法律层面来看，合法性主要取决于组织的规定是否合法、合规，以及人事司的决定是否遵循了这些规定。
   • 如果组织的规定符合相关法律法规，且人事司的决定是基于这些规定作出的，那么该决定在法律上是合法的。
   • 然而，如果组织的规定或人事司的决定存在违法、违规或不合理之处，那么该决定的合法性就可能受到质疑。

4. 建议：

   • 对于您的情况，我建议您首先查阅组织的相关规定和纪律要求，了解报备制度的具体内容和要求。
   • 如果您认为人事司的决定存在不合理之处，可以尝试与人事司进行沟通，说明您的实际情况和理由，争取得到理解和支持。
   • 如果沟通无果，您还可以考虑向更高层级的领导或相关部门反映情况，寻求更公正的解决方案。

综上所述，人事司不允许补报备的决定是否合法，主要取决于组织的规定是否合法、合规，以及该决定是否遵循了这些规定。在无法直接判断合法性的情况下，我建议您通过查阅规定、沟通协商和反映情况等方式来寻求解决方案。