水源保护地划入高标准农田建设项目区是否合法，需根据具体情况及法律法规综合判断，不能一概而论。以下从几个关键角度进行分析：
一、法律法规依据
水源保护地的法律规定：
- 水源保护地通常受到《中华人民共和国水污染防治法》、《中华人民共和国水法》等法律法规的严格保护，旨在保障饮用水安全，防止水源污染。
- 在水源保护区内，通常禁止或限制一系列可能污染水源的活动，如排放污染物、建设污染项目等。
高标准农田建设的法律规定：
- 高标准农田建设旨在提高农田质量，增加粮食产量，改善农业生产条件，通常受到《中华人民共和国土地管理法》、《基本农田保护条例》等法律法规的规范。
- 高标准农田建设需符合土地利用总体规划和农田保护规划，且不得破坏生态环境和自然资源。
二、合法性分析
规划兼容性：
- 如果水源保护地的划定与高标准农田建设项目区的规划在空间上存在重叠，首先需审查两者规划是否兼容。
- 若高标准农田建设不会对水源保护地的水质、水量等造成不利影响，且符合相关环保要求，则可能具有合法性。
- 反之，若建设活动可能污染水源或破坏水源保护地的生态环境，则通常不合法。
审批程序：
- 任何涉及土地利用变更或建设项目，均需经过相关部门的审批。
- 水源保护地划入高标准农田建设项目区，需经过水利、环保、农业等多部门的联合审批，确保符合相关法律法规和规划要求。
- 若未经审批或审批程序不合法，则该行为不合法。
生态保护与补偿机制：
- 在水源保护地内进行建设活动，应建立生态保护与补偿机制，确保对水源保护地的生态环境进行充分保护和合理补偿。
- 若缺乏相应的生态保护与补偿措施，则该行为可能不合法。
三、建议与行动
审查规划文件：
- 建议首先审查水源保护地和高标准农田建设项目的规划文件，了解两者在空间上的关系及规划要求。
咨询相关部门：
- 向当地水利、环保、农业等部门咨询，了解该行为是否经过审批及审批程序是否合法。
评估环境影响：
- 若可能，建议委托专业机构对高标准农田建设项目对水源保护地的影响进行评估，以科学判断其合法性。
法律途径：
- 若认为该行为不合法且损害了自身权益，可通过法律途径维护自身权益，如提起行政诉讼或民事诉讼等。
总结来说，水源保护地划入高标准农田建设项目区的合法性需根据具体情况及法律法规综合判断。在涉及此类问题时，建议充分审查规划文件、咨询相关部门、评估环境影响，并在必要时通过法律途径维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。