核心结论：双方协议离婚，儿子归男方抚养但实际与女方生活，在书写相关材料时，重点要明确抚养权归属、实际抚养情况以及双方的权利义务等内容，以下是具体材料书写要点及示例。

材料书写要点

1. 标题：明确材料性质，如“离婚协议书” 。
2. 双方信息：写明夫妻双方的姓名、身份证号、联系方式等基本信息。
3. 离婚意愿：清晰表明双方自愿离婚的意思表示。
4. 子女抚养安排
   • 抚养权归属：明确写明儿子抚养权归男方。
   • 实际抚养情况：详细说明儿子虽抚养权归男方，但实际与女方生活，包括生活起居照顾、教育费用承担等方面的情况。
   • 探视权：规定男方对儿子的探视权，包括探视的时间、方式等，以保障男方与儿子的亲情交流。
5. 财产分割：对夫妻共同财产进行合理分割，如房产、车辆、存款等，明确各自分得的财产。
6. 债务处理：说明夫妻共同债务的承担方式，如有债务应明确由哪方承担或双方按何种比例承担。
7. 违约责任：约定若一方违反协议约定，应承担的违约责任，以保障协议的履行。
8. 签字及日期：双方签字并注明签订协议的日期。

示例

离婚协议书

男方：[男方姓名]，身份证号：[男方身份证号码]，联系电话：[男方电话号码] 女方：[女方姓名]，身份证号：[女方身份证号码]，联系电话：[女方电话号码]

男方与女方于[结婚日期]在[结婚登记地点]登记结婚，婚后于[子女出生日期]生育儿子/女儿，取名[子女姓名]。现因[离婚原因]致使夫妻感情确已破裂，已无和好可能，现经夫妻双方自愿协商达成一致意见，订立离婚协议如下：

一、男女双方自愿离婚

双方确认夫妻感情已破裂，且无和好可能，双方自愿解除婚姻关系。

二、子女抚养、抚养费及探视权

1. 抚养权归属：儿子/女儿[子女姓名]的抚养权归男方所有。
2. 实际抚养情况：考虑到实际情况，儿子/女儿[子女姓名]自本协议签订之日起实际与女方共同生活，由女方负责其日常生活起居照顾。儿子的教育费用（包括但不限于学费、书本费、培训费等）、医疗费用等实际发生费用，由男女双方各承担 50%。女方应在每[具体时间周期，如季度]结束后[X]日内，将该周期内儿子实际发生的教育费用、医疗费用等凭证提供给男方，男方应在收到凭证后[X]日内将应承担的费用支付给女方。
3. 探视权：男方享有对儿子的探视权。男方可在每周[具体探视时间，如周六上午 9 点至下午 5 点]到女方住处接走儿子，并于当日将儿子送回女方住处。在国家法定节假日、寒暑假等特殊期间，双方可另行协商探视时间和方式，但应提前[X]日通知对方。

三、财产分配

1. 房产：夫妻共同拥有的位于[房产地址]的房产一套，房产证号为[房产证编号]，归男方所有。男方应于本协议签订之日起[X]日内，支付给女方房屋补偿款[X]元。女方应在收到补偿款后[X]日内，配合男方办理房屋产权变更登记手续。
2. 车辆：夫妻共有的[车辆品牌及型号]汽车一辆，车牌号为[车牌号]，归女方所有。女方应于本协议签订之日起[X]日内，支付给男方车辆补偿款[X]元。男方应在收到补偿款后[X]日内，配合女方办理车辆过户手续。
3. 存款：双方名下的银行存款共计[X]元，其中男方名下的存款[X]元归男方所有，女方名下的存款[X]元归女方所有。
4. 其他财产：双方各自的衣物、首饰等个人生活用品归各自所有。

四、债务处理

1. 夫妻关系存续期间，为家庭共同生活所负的债务共计[X]元，由男女双方各承担 50%。具体债务情况如下：[详细列出债务名称、债权人、债务金额等信息]。
2. 除上述债务外，各自名下的其他债务由各自承担。如因一方债务问题导致另一方承担连带责任的，承担责任方有权向对方追偿。

五、违约责任

若任何一方不按本协议约定履行相关义务，应向对方支付违约金[X]元，并赔偿对方因此遭受的损失（包括但不限于律师费、诉讼费、差旅费等）。

六、争议解决

如双方在履行本协议过程中发生争议，应首先协商解决；协商不成的，任何一方均有权向有管辖权的人民法院提起诉讼。

七、其他事项

本协议一式三份，自婚姻登记机关颁发《离婚证》之日起生效，男、女双方各执一份，婚姻登记机关存档一份。

男方（签字）：__________________ 日期：___年_月____日

女方（签字）：__________________ 日期：___年_月____日

以上内容仅供参考，你可以根据实际情况进行修改和调整。如果在书写过程中还有其他疑问，随时可以向我咨询。