结论：劳务协议工作超时是否有加班费，首先需依据劳务协议中的具体约定；若无约定或约定不明，则参照《中华人民共和国劳动法》的相关规定来确定加班费用。

一、劳务协议约定优先

1. 依据：劳务协议主要受《民法典》等民事法律规范的调整，双方应优先按照劳务协议中对加班及加班费计算的明确约定来执行。
2. 具体约定：劳务协议中可能明确每小时加班费用是正常工作小时报酬的一定倍数（如1.5倍、2倍等），或直接约定一个固定的加班费用金额。若协议中有此类明确约定，则按照约定执行。

二、《劳动法》相关规定参照

当劳务协议中没有对加班及加班费作出约定或约定不明确时，可参照《劳动法》的相关规定来确定加班费用。

1. 加班工资计算标准：

   • 正常工作日加班：支付不低于工资的150%的工资报酬。计算公式为：加班费 = 正常工作小时工资 × 150% × 加班小时数。
   • 休息日加班：若不能安排补休，支付不低于工资的200%的工资报酬。计算公式为：加班费 = 正常工作小时工资 × 200% × 加班小时数。
   • 法定节假日加班：支付不低于工资的300%的工资报酬。计算公式为：加班费 = 正常工作小时工资 × 300% × 加班小时数。

2. 加班时间限制：

   • 一般每日不得超过一小时；特殊原因下，每日不得超过三小时，每月不得超过三十六小时。这是为了保护劳动者的身心健康，避免过度劳累。

3. 特殊情况例外：在自然灾害、事故等紧急情况下，或生产设备、交通设施等发生故障必须及时抢修时，延长工作时间可不受上述限制。但这种情况较为特殊，且需确保劳动者的安全与健康。

三、无约定时的处理

若劳务协议中没有相关约定，且无法参照《劳动法》的具体规定（如劳务关系不适用《劳动法》的某些条款），双方应进行协商补充约定。若协商不成，通常按照实际造成的损失或参考行业通行标准来确定加班费用。这要求双方在协商过程中保持诚信与公平，以达成合理的加班费用标准。

四、法律保障与维权途径

1. 法律保障：虽然劳务协议主要遵循约定，但若劳动者超时加班的权益受到严重侵害，如用人单位恶意拖欠或不合理压低加班费用，劳动者有权向人民法院提起民事诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
2. 维权途径：劳动者还可选择向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。法院或仲裁机构会综合各方面因素，如劳动者的实际工作时长、劳动强度、行业惯例以及双方的过错程度等，作出公正的判决或裁决。

建议：在签订劳务协议时，劳动者应仔细阅读协议条款，特别是关于加班及加班费计算的部分，确保自己的权益得到充分保障。若协议中存在模糊或不明确的地方，应及时与用人单位沟通并明确约定。若遇到超时加班但未获得相应加班费的情况，劳动者应积极维护自己的合法权益，通过协商、投诉或诉讼等途径来解决问题。

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