公司以扣分办法实施罚款的合理性需分情况讨论，具体结论如下：

1. 若公司扣分后直接关联经济处罚（如扣工资），则通常不合法
   根据《工资支付暂行规定》第十六条，用人单位仅在劳动者因本人原因造成经济损失时，可按劳动合同约定要求赔偿，且每月扣除部分不得超过当月工资的20%。若公司以“扣分”为名变相罚款（如扣1分=扣50元），且未满足以下条件，则属于违法行为：

   • 未与劳动者签订书面协议约定赔偿规则；
     
   • 扣除金额超过法定比例；
     
   • 无法证明经济损失由劳动者直接导致。
     法律依据：《劳动合同法》第三十条、《工资支付暂行规定》第十六条。

2. 若扣分仅作为内部管理手段（不涉及经济处罚），则可能合法
   若公司通过扣分记录员工行为（如迟到、违规操作），并将扣分结果与绩效考核、晋升、培训等挂钩，而非直接扣减工资，则属于企业自主管理权范畴。但需满足：

   • 规章制度经民主程序制定（如职工代表大会讨论）；
     
   • 内容不违反法律强制性规定（如不得歧视、侵犯人格权）；
     
   • 已向劳动者公示或告知。
     法律依据：《劳动合同法》第四条。

3. 特殊情形：地方性法规允许的“罚款”
   部分地区（如深圳）允许企业通过民主程序制定轻微罚款规则，但需严格限制：

   • 罚款金额不得超过当月工资的20%；
     
   • 仅适用于严重违反规章制度的行为（如盗窃、旷工）；
     
   • 需在劳动合同或规章制度中明确约定。
     注意：此类规定存在地域差异，需结合当地司法实践判断。

建议行动：

• 若公司扣分后直接扣钱，可要求公司出示书面赔偿协议及经济损失证据；
  
• 若扣分仅影响非经济权益（如评优），可核查规章制度是否经民主程序公示；
  
• 保留考勤记录、工资条、扣分通知等证据，必要时向劳动监察部门投诉或申请仲裁。
  

如有进一步细节（如扣分规则内容、地区、行业等），可提供更多信息以便针对性分析。