公司扣分罚款是否合法需分情况讨论，具体取决于扣分罚款的依据、程序及实施主体等因素。以下从不同角度展开分析：
若公司扣分罚款依据为合法有效的规章制度
根据《劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或决定直接涉及劳动者切身利益的规章制度（如奖惩制度）时，需经职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定，且需公示或告知劳动者。若公司扣分罚款制度符合上述民主程序且内容合法（如罚款金额不超过月工资的20%、不违反法律强制性规定等），则可能被认定为合法。但需注意，法律对用人单位罚款权有严格限制，仅在劳动者因故意或重大过失给用人单位造成经济损失时，用人单位方可按劳动合同约定要求赔偿，且每月扣除部分不得超过月工资的20%。
若公司扣分罚款缺乏合法依据或程序违法
若公司未通过民主程序制定扣分罚款制度，或制度内容违反法律强制性规定（如罚款金额过高、以罚款代替管理目的等），则该制度可能被认定为无效。此外，用人单位并非行政机关，无行政处罚权，若公司以“罚款”名义直接扣减工资，可能涉嫌违法克扣工资，劳动者有权依据《劳动争议调解仲裁法》申请劳动仲裁，要求公司补发工资并支付经济补偿。
特殊情形：服务期或竞业限制违约金
若劳动者违反服务期约定或竞业限制义务，用人单位可依据《劳动合同法》第二十二条、第二十三条要求支付违约金，但此情形与“扣分罚款”性质不同，需严格区分。
建议：若您遭遇公司扣分罚款，可先核查公司制度是否经民主程序制定、是否公示告知、罚款依据是否合法；若制度违法或程序瑕疵，可向公司提出异议，或向劳动监察部门投诉，必要时申请劳动仲裁维护权益。如有具体细节需进一步分析，可直接向我咨询。