关于公司考核扣钱罚款是否合法的问题，这是一个涉及劳动法和企业管理制度的重要议题。以下是我为您提供的详细分析：
一、公司直接罚款的违法性
首先，需要明确的是，公司直接以考核名义对员工进行罚款通常是违法的。罚款属于公权力范畴，其行使必须有明确的法律依据。企业作为民事主体，与员工之间建立的是平等的劳动关系，并不具备对员工进行罚款的法律权限。根据《中华人民共和国行政处罚法》以及相关劳动法规，罚款是行政处罚的一种，只能由法律、法规授权的行政机关或其他组织实施，企业无权擅自对员工进行罚款。
二、合法的管理手段与经济约束
尽管公司无权直接罚款，但可以通过制定合法有效的规章制度及绩效考核制度来管理员工，并实施相应的经济管理措施。这些措施应基于以下原则：
规章制度合法有效：公司的规章制度必须经过民主程序制定，内容不违反法律法规的强制性规定，并已向员工公示或告知。这样的规章制度才能作为管理员工的依据。
绩效考核与薪酬挂钩：公司可以设立绩效考核制度，将员工的工作表现、出勤情况、工作质量等纳入考核范围。对于达到考核要求的员工给予全额奖励或薪酬，未达到要求的则按比例或减少奖励。但需要注意的是，绩效考核制度必须公平、公正、公开，且扣减的金额和方式需符合相关法律规定，不得随意扣除员工工资。
经济损失的赔偿：如果员工因个人原因给公司造成经济损失，公司可以依据劳动合同约定要求赔偿。但赔偿应通过合法途径进行，且扣除金额应合理，不得损害员工的基本生活权益。根据《工资支付暂行规定》，每月扣除部分不得超过当月工资的20%，并确保扣除后剩余工资不低于当地最低工资标准。
三、实际应用中的建议
完善内部规章制度：企业应确保内部规章制度合法合规，明确员工的行为规范和奖惩机制。同时，规章制度应经过民主程序制定，并向员工公示或告知，以确保其有效性和可执行性。
加强沟通与教育：企业应加强与员工的沟通，解释规章制度和绩效考核标准的目的和意义。对于违反规章制度的员工，应给予必要的教育和指导，帮助其改正错误行为，而不是直接采取罚款措施。
合理利用法律途径：如果员工的行为确实给公司造成了损失，企业应通过法律途径进行追偿，如提起民事诉讼要求员工赔偿损失。这既能维护企业的合法权益，又能避免违法罚款带来的法律风险。
综上所述，公司直接以考核名义对员工进行罚款是违法的。但公司可以通过制定合法有效的规章制度及绩效考核制度来规范员工行为并实施相应的经济管理措施。在实际操作中，公司应严格遵守法律法规，确保管理制度的合理性和合法性，以维护良好的劳动关系和企业形象。