司机受伤且车辆挂靠公司的情况下，司机可依据不同法律关系向相关责任方主张权利，具体如下：

1. 司机与挂靠公司之间存在劳动关系时

   • 若司机受挂靠公司直接管理（如考勤、工资发放等），且双方签订劳动合同或形成事实劳动关系，则司机受伤属于工伤。
     
   • 处理流程：
     
     1. 司机应在受伤后30日内由公司或1年内自行向社保部门申请工伤认定；
        
     2. 认定为工伤后，享受工伤保险待遇（医疗费、停工留薪期工资、伤残补助等）；
        
     3. 若公司未缴纳工伤保险，由公司承担全部赔偿费用。
        
   • 法律依据：《工伤保险条例》第14条、第62条。

2. 司机与挂靠公司之间为劳务关系时

   • 若司机以个人名义提供劳务（如临时驾驶、按趟计费），双方形成劳务关系，则适用《民法典》侵权责任条款。
     
   • 处理原则：
     
     1. 若司机因自身过错受伤，自行承担责任；
        
     2. 若因挂靠公司未提供安全条件（如车辆故障、指令违规）导致受伤，公司需按过错比例赔偿；
        
     3. 若因第三人侵权（如其他车辆碰撞）受伤，可同时向侵权方和公司主张赔偿（公司未尽安全保障义务时）。
        
   • 法律依据：《民法典》第1192条、第1165条。

3. 车辆挂靠协议的效力影响

   • 若挂靠协议约定“司机受伤由司机自行负责”，该条款因违反《民法典》第153条（违背公序良俗）而无效，公司仍需承担法定责任。
     
   • 若协议约定“公司协助处理保险理赔”，则公司需履行协助义务，但不影响司机直接向保险公司索赔或向公司主张补充赔偿。

4. 保险理赔的并行处理

   • 交强险/商业三者险：若事故涉及第三方，保险公司优先在交强险范围内赔偿，不足部分由商业险补充；
     
   • 车上人员责任险：若公司为车辆投保该险种，司机可向保险公司主张赔偿；
     
   • 雇主责任险：若公司投保该险种，司机受伤后由保险公司直接向公司赔付，公司再转付司机。
     
   • 注意：保险理赔与侵权/工伤赔偿可并行主张，但医疗费等实际支出部分不得重复获赔。

行动建议：

1. 立即收集证据：事故认定书、医疗记录、工资流水、挂靠协议、保险单等；
   
2. 优先申请工伤认定（若符合劳动关系条件）；
   
3. 同时向公司、保险公司、侵权方（如有）发出书面索赔通知；
   
4. 若协商无果，可在1年内申请劳动仲裁（工伤）或3年内向法院起诉（侵权）。
   

提示：挂靠关系下责任主体复杂，建议根据具体证据材料进一步分析责任比例及赔偿路径。如有疑问，可直接向我提供细节后继续咨询。