超载车辆驾驶员书面申请只卸货不处罚，这一做法并不合法。以下从多个角度进行分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，超载是违法行为，交通管理部门有权对超载车辆进行处罚，包括罚款、扣分等。这些规定旨在维护道路交通安全，防止因超载引发的交通事故。
   • 卸货是超载处理的一个环节，但卸货并不等同于处罚的替代。卸货是为了消除超载状态，而处罚则是对违法行为的制裁。

2. 法律程序：

   • 交通管理部门在处理超载车辆时，应遵循法定程序，包括检查、取证、告知、处罚等步骤。驾驶员书面申请只卸货不处罚，并不符合法定程序，交通管理部门不能因此免除对驾驶员的处罚。
   • 如果驾驶员对处罚有异议，可以通过合法途径进行申诉或复议，但不能通过书面申请的方式免除处罚。

3. 实际后果：

   • 如果允许驾驶员书面申请只卸货不处罚，将破坏法律的严肃性和权威性，导致超载行为得不到有效遏制，进而威胁道路交通安全。
   • 同时，这也可能引发其他驾驶员的效仿，形成不良风气，增加交通管理的难度和成本。

4. 建议与措施：

   • 对于超载车辆，交通管理部门应依法进行处罚，并督促驾驶员及时卸货，消除超载状态。
   • 驾驶员应自觉遵守交通法规，不超载行驶，共同维护道路交通安全。
   • 如果驾驶员对处罚有异议或认为处理不当，可以通过合法途径进行申诉或复议，以维护自己的合法权益。

总结来说，超载车辆驾驶员书面申请只卸货不处罚的做法是不合法的。交通管理部门应依法对超载车辆进行处罚，并督促驾驶员及时卸货。驾驶员应自觉遵守交通法规，共同维护道路交通安全。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。